Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
20401	COc1cccc(-c2cc(C(=O)Nc3cc(C(=O)O)cc(N4CCOCC4)c3C(F)(F)F)cc(C(F)(F)F)c2)c1	AlphaDrug	5BUR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20402	COc1cccc(-c2cc(C(=O)Nc3cc(C(=O)O)cc(F)c3C(F)(F)F)cc(C(F)(F)F)c2)c1	AlphaDrug	5BUR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20403	COc1cccc(-c2cc(C(=O)NC3CN(S(=O)(=O)c4ccc(F)cc4)CC3CN)cc(C(F)(F)F)c2)c1	AlphaDrug	5BUR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20404	COc1cccc(-c2cc(C(=O)Nc3cc(C(C)(C)C(=O)O)ccc3Cl)cc(C(F)(F)F)c2)c1	AlphaDrug	5BUR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20405	COc1cccc(C2CN(CCC(=O)Nc3cc(C(N)=O)cc(-c4ccc(C(F)(F)F)cc4)c3)CC2O)c1	AlphaDrug	5BUR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20406	COc1cccc(-c2cc(C(=O)NC3CCC(C(=O)O)CC3)cc(C(C)(C)C(F)(F)F)c2)c1	AlphaDrug	5BUR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20407	COc1cccc(-c2cc(C(=O)Nc3cc(N4CCC(O)(C(=O)O)CC4)cc(C(F)(F)F)c3)cc(C(F)(F)F)c2)c1	AlphaDrug	5BUR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20408	COc1cccc(-c2cc(C(=O)Nc3cc(N4C=CC(N)CC4)cc(C(F)(F)F)c3)cc(C(F)(F)F)c2)c1	AlphaDrug	5BUR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20409	COc1cccc(-c2cc(C(=O)Nc3ccc(C)c(NS(C)(=O)=O)c3)cc(C(F)(F)F)c2)c1	AlphaDrug	5BUR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20410	COc1cccc(-c2cc(C(=O)Nc3cc(C(=O)O)cc(C(F)(F)F)c3)cc(C(F)(F)F)c2)c1	AlphaDrug	5BUR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20411	COc1cccc(-c2cc(C(=O)NC3CC(O)CC(C(=O)O)C3)cc(C(F)(F)F)c2)c1	AlphaDrug	5BUR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20412	COc1cccc(-c2cc(C(=O)Nc3cc(N4CCC(O)CC4)cc(C(F)(F)F)c3)cc(C(F)(F)F)c2)c1	AlphaDrug	5BUR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20413	COc1cccc(-c2cc(C(=O)Nc3cc(C(F)(F)F)nc(N)c3C(F)(F)F)cc(C(F)(F)F)c2)c1	AlphaDrug	5BUR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20414	COc1cccc(-c2cc(S(=O)c3ccc(C4(C(=O)NNCC(O)CC(O)CC(=O)O)CC4)cc3)cc(C(F)(F)F)c2)c1	AlphaDrug	5BUR	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20415	COc1cccc(-c2cc(C(=O)Nc3cc([N+](=O)[O-])ccc3C)cc(C(F)(F)F)c2)c1	AlphaDrug	5BUR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

20401 to 20415 of 73725 items. Total 4915 pages.