Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
20851	CCOc1cc(-c2ccc(C)c(NS(=O)(=O)c3cccc(C#N)c3)c2)ccc1-c1ccc2c(N)cccc2n1	AlphaDrug	5J6N	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20852	CC(c1ccc(C(C(=O)NCC(F)(F)F)C(F)(F)F)cc1)N1CCN(c2ccccc2)CC1	AlphaDrug	6G98	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20853	CC(c1ccc(C(=O)NC(Cc2ccccc2)C(=O)NO)cc1)N1CCN(c2ccccc2)CC1	AlphaDrug	6G98	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20854	CC(c1ccc(C(=O)NC2CCCCN2C(=O)c2ccc(C(F)(F)F)cc2)cc1)N1CCN(c2ccccc2)CC1	AlphaDrug	6G98	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20855	CC(c1ccc(C(=O)NC(Cc2ccc(O)cc2)C(=O)NC(CCCN)C(=O)O)cc1)N1CCN(c2ccccc2)CC1	AlphaDrug	6G98	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20856	CC(Nc1cccc(C(=O)Nc2ccc(N)cc2)c1)c1ccc(C(=N)N)cc1	AlphaDrug	6G98	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20857	CC(c1ccc(C(=O)NC(CC(=O)O)C(=O)NC(C(F)(F)F)C(F)(F)F)cc1)N1CCN(c2ccccn2)CC1	AlphaDrug	6G98	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20858	CC(c1ccc(C(=O)NC(Cc2c[nH]c3ccccc23)C(=O)O)cc1)N1CCN(c2ccccc2)CC1	AlphaDrug	6G98	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20859	CC(CN1CCc2ccc(Cl)cc21)NC(=O)c1ccc(S(N)(=O)=O)cc1	AlphaDrug	6G98	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20860	CC(c1ccc(C(N)=O)cc1)N1CCN(c2ccc(-c3ccccc3)cc2)CC1	AlphaDrug	6G98	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20861	CC(c1ccc(-c2ccc(C(=O)NC(CCCN)C(N)=O)cc2)cc1)N1CCN(c2ccccc2)CC1	AlphaDrug	6G98	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20862	CCC(=O)N1CCC(Nc2cc(-c3ccc(S(C)(=O)=O)cc3)cc(NCc3nnc(-c4ccccc4)o3)n2)CC1	AlphaDrug	5LIF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20863	CCC(=O)N1CCC(Nc2cc(-c3ccc(F)c(F)c3)cc(NCc3nnc(-c4ccccc4)o3)n2)CC1	AlphaDrug	5LIF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20864	CCC(=O)N1CCC(Nc2cc(S(C)(=O)=O)c(F)cc2C(=O)NCCCCCCC(=O)O)CC1	AlphaDrug	5LIF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20865	CCC(=O)N1CCC(Nc2cc(-c3cccc(F)c3)cc(NCc3nnc(-c4ccccc4)o3)n2)CC1	AlphaDrug	5LIF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

20851 to 20865 of 73725 items. Total 4915 pages.