Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
196	CN1CCN(c2ccc(C(=O)NC3CCCCN(c4ccccc4C(=O)C(Cc4ccccc4)NC(=O)OCc4ccccc4)C3)cc2)CC1	AlphaDrug	5KBY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
197	CN1CCN(c2ccc(S(=O)(=O)NC(Cc3ccccc3)C(=O)NCc3ccccc3)cc2)CC1	AlphaDrug	5KBY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
198	CC1CN(Cc2ccc(S(N)(=O)=O)cc2)CCN1C(=O)c1ccc(-c2ccccc2)c(Cl)c1	AlphaDrug	5KZ0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
199	CC1CN(Cc2ccc(-n3cnc4c(-c5ccc(F)cc5)cccc4c3=O)cc2)C=CN1C(=O)c1ccccc1	AlphaDrug	5KZ0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
200	Cc1cc(-c2ccccc2)cc2c(=O)n(-c3ccc(CN4CC(C)C4)cc3)cnc12	AlphaDrug	5KZ0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
201	CC1CN(Cc2ccc(-c3cc(N4CC=CCC4)nc4ccccc34)cc2)CCN1C(=O)c1cccc(C(F)(F)F)c1	AlphaDrug	5KZ0	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
202	Cc1cc(C)c2ncn(-c3ccc(CN4CCN(C(=O)c5cccc(C(F)(F)F)c5)C(C)C4)cc3)c2c1C	AlphaDrug	5KZ0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
203	CC1CN(c2ccc(-c3ccc(F)cc3)cc2)C2CCC(CC2)N1	AlphaDrug	5KZ0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
204	CC1CN(Cc2ccc3c(c2)n(C2CC2)c(=O)n3C)CCN1C(=O)c1cccc(Cl)c1	AlphaDrug	5KZ0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
205	CC1CN(Cc2ccc(-n3cnc4cc(C(=O)O)ccc43)cc2)CCN1C(=O)c1cccc(C(F)(F)F)c1	AlphaDrug	5KZ0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
206	CN(C)C(=O)C(NC(=O)c1ccc(-c2cccc(NS(=O)(=O)c3ccc(-c4ccccc4)cc3)c2)cc1)c1ccccc1	AlphaDrug	5OBG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
207	CN(C)C(=O)C(NC(=O)c1ccc(-c2cccc(-c3ccccc3)c2)cc1)c1cccc(-c2cccc(-c3ccccc3)c2)c1	AlphaDrug	5OBG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
208	CN(C)C(=O)C(NC(=O)c1ccc(-c2cccc(C3CCCCC3)c2)cc1)c1cccc(-c2ccccc2)c1	AlphaDrug	5OBG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
209	CN(C)C(=O)C(NC(=O)c1ccc(-c2cccc(NC(=O)Nc3ccccc3)c2)cc1)c1cccc(-c2cccc(N)c2)c1	AlphaDrug	5OBG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
210	CN(C)C(=O)C(NC(=O)c1ccc(-c2cccc(NC(=O)Nc3ccccc3)c2)cc1)c1cccc(-c2ccccc2C(=O)NCc2ccccc2)c1	AlphaDrug	5OBG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

196 to 210 of 73725 items. Total 4915 pages.