Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
2701	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)c1cccc2ccccc12)C(=O)NCc1ccc(O)cc1	AlphaDrug	5EEK	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2702	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)c1cccc2ccccc12)C(=O)NCc1ccc(O)c(Cl)c1	AlphaDrug	5EEK	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2703	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C(CO)NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C(N)CCCN)C(=O)O	AlphaDrug	5EEK	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2704	COc1ccc(C(C)Nc2cc(N=C(N)N)cc(-c3ccc(C4CCC(O)(c5ncnn5C)CC4)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	4KCQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2705	COc1ccc(C(=O)Nc2cccc(-c3ccc(C4CCN(C(=O)Nc5ccc(C(F)(F)F)cc5C(F)(F)F)CC4)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	4KCQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2706	COc1ccc(C(C)Nc2cc(N=C(N)N)cc(-c3ccc(C4CCOCC(O)(C(F)(F)F)CC4)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	4KCQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2707	COc1ccc(C(C)Nc2cc(N=C(N)N)cc(-c3ccc(C4CCC(O)(C(F)(F)F)CC4)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	4KCQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2708	COc1ccc(C(C)Nc2cc(N=C(N)N)cc(-c3ccc(C4CC=NCCC4)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	4KCQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2709	COc1ccc(C(C)Nc2cc(N=C(N)N)cc(-c3ccc(C4CCCC(O)(C(=O)O)C4)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	4KCQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2710	COc1ccc(C(C)Nc2cc(N=C(N)N)cc(-c3ccc(C4CCC(NC(=O)NCC(=O)O)CC4)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	4KCQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2711	COc1ccc(C(C)Nc2cc(N=C(N)N)cc(-c3ccc(C4CCN(C(=N)N)CC4)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	4KCQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2712	COc1ccc(C(C)Nc2cc(N=C(N)N)cc(-c3ccc(C4CCN(S(C)(=O)=O)CC4)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	4KCQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2713	COc1ccc(C(C)NC2CCN(C(=O)NCC3CCCC(NC(=O)NC4CCC(C(=O)O)C4)CC3)CC2)cc1	AlphaDrug	4KCQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2714	COc1ccc(C(C)Nc2cc(N=C(N)N)cc(-c3ccc(C4CCC(N(C)C)CC4)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	4KCQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2715	COc1ccc(C(C)Nc2cc(N=C(N)N)cc(-c3ccc(C4CCCN(C(=O)CC(=O)O)CC4)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	4KCQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

2701 to 2715 of 73725 items. Total 4915 pages.