Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
316	CS(=O)(=O)c1ccc(-c2cc(Cc3ccc4c(c3)C(c3cccc(C#N)c3)CO4)cc3cc(O)ccc23)cc1	AlphaDrug	4A9J	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
317	CS(=O)(=O)c1ccc(-c2cc(Cc3ccc4c(c3)C(c3cccc(OC(F)(F)F)c3)CO4)cc3ccccc23)cc1	AlphaDrug	4A9J	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
318	CS(=O)(=O)c1ccc(-c2cc(Cc3ccc(OC(F)(F)F)c(F)c3)cc3c(SCC(=O)NC4CCCC4)cccc23)cc1	AlphaDrug	4A9J	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
319	CS(=O)(=O)c1ccc(-c2cc(Cc3ccc(O)c(O)c3)cc3cc(OCOc4cccc(C(F)(F)F)c4)ccc23)cc1	AlphaDrug	4A9J	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
320	CS(=O)(=O)c1ccc(-c2cc(/C=C/c3cc(F)cc(F)c3)c3ccccc3c2)cc1	AlphaDrug	4A9J	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
321	CS(=O)(=O)c1ccc(-c2cc(Cc3ccc(OCc4ccccc4)cc3)ccc2C(F)(F)F)cc1	AlphaDrug	4A9J	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
322	CS(=O)(=O)c1ccc(-c2cc(Cc3ccc(O)c(O)c3)cc3cc(OCC(=O)NO)ccc23)cc1	AlphaDrug	4A9J	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
323	CS(=O)(=O)c1ccc(-c2cc(Cc3ccc4c(c3)C(c3cn[nH]c3-c3ccc(C#N)cc3)CO4)cc3cn[nH]c23)cc1	AlphaDrug	4A9J	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
324	CS(=O)(=O)c1ccc(-c2cc(Cc3ccc(OC(F)(F)F)c(F)c3)cc(-c3ccc(C(N)=O)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	4A9J	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
325	CS(=O)(=O)c1ccc(-c2cc(Cc3ccc(OC(F)(F)F)c(F)c3)cc3c2CNC(=O)CC(C2CCCCC2)C3)cc1	AlphaDrug	4A9J	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
326	CS(=O)(=O)c1ccc(-c2cc(Cc3ccc(O)c(O)c3)cc3cc(OCOc4cccc(O)c4)ccc23)cc1	AlphaDrug	4A9J	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
327	Cc1ccc(O)cc1C(=O)c1cc(C(=O)O)cc(-c2cccc(C3CCCCC3)c2)c1	AlphaDrug	4A9J	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
328	CS(=O)(=O)c1ccc(-c2cc(Cc3ccc(O)c(O)c3)cc3cc(OCOc4ccc(O)c(O)c4)ccc23)cc1	AlphaDrug	4A9J	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
329	CC1CN(S(=O)(=O)c2ccc(-c3ccccc3)cc2)CCN1c1cccc(Oc2ccc(O)c(Cl)c2)c1	AlphaDrug	4A9J	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
330	Cc1ccc(O)cc1C(=O)c1cc(C(=O)O)cc(-c2ccc(F)c(CC(O)c3ccc(F)c(F)c3)c2)c1	AlphaDrug	4A9J	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

316 to 330 of 73725 items. Total 4915 pages.