Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
436	CC(C)Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(N3CCCC3CNS(=O)(=O)/C3=C/C=C4/OCCCCCCCCCCCCCCCC(COCC(=O)N3)c3cccccc4ccc3)C2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
437	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccc(-c2ccccc2)cc1)NC(=O)C1CCCN1C(=O)C1CCCC1)C(=O)O	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
438	COc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(NC(=O)N3CCC(N4CCCCC4)CC3)CC2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
439	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCN(C(=O)C2CCOCC2)CC1)C1CCCC1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
440	CC(C)Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(N3CCC(C(=O)O)CCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)NS3(=O)=O)C2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
441	CC(C)Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(N3CCCC3CNS(=O)(=O)/C3=C/C=C(c4ccc(O)cc4)OCCCCCCCCCCCCCCCC3O)C2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
442	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCN(C(=O)Cc2ccccc2)CC1)C1CCCCCCCCCCCC(=O)N1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
443	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCN(C(=O)Cc2ccccc2)CC1)C1CCC/C=C\CCCCCC(=O)N1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
444	COc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(C3NS(=O)(=O)/C4=C/C=C(/c5ccccc5)OCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(OCC(N)C4O)c4ccccc43)CC2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
445	CC(C)COc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(C3CC(=O)N3CCC3CCC(CCCCCN4CCCCC4)NC(=O)CCCCCC(=O)N3)CC2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
446	CC(C)Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(N3CCCC3CNS(=O)(=O)c3ccc(-c4ccccn4)c(F)c3)C2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
447	CC(C)Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(N3CCCC3CNS(=O)(=O)/C3=C/C=C4/OCCCCCCCCCCCCCCC(COCC(O)C3)c3cccccc4ccc3)C2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
448	COc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(N(c3cccnc3)C3CCN(C(=O)c4ccc(C(F)(F)F)cc4)CC3)C2)cc1OC	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
449	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCN(C(=O)C2CCCCC2)CC1)C(=O)NC1CCCCC1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
450	CC(C)Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(N3CCCC(NC(=O)N4CCC(N5CCCCC5)CC4)CC3)C2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

436 to 450 of 73725 items. Total 4915 pages.