Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
451	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCN(C(=O)C(C)C)CC1)C(=O)N1CCCC(C2CCCCC2)CC1	AlphaDrug	3B6H	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
452	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCN(c2ccc(F)cc2)CC1)C1CCCCC1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
453	CC(C)COc1ccc(S(=O)(=O)N2CCC(O/C3=C/C=C4/C=C\NC(=O)CCCC3C(=O)SCCCCCCCCCCCCCCO4)CC2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
454	CC(C)CN(Cc1ccccc1)C(=O)CCc1ccc2ccccc2c1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
455	CC(C)Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(N3CCCC3CNS(=O)(=O)/C3=C/C=C4/OCCCCCCCCCCCCCCCC(OCC(O)C3)c3cccccc4ccc3)C2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
456	CC(C)Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(N3CCCC3CNS(=O)(=O)/C3=C/C=C4/OCCCCCCCCCCCCCCC(CC(O)C(O)C3)c3cccccc4ccc3)C2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
457	CC(C)Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(N3CCCC3CNS(=N)(=O)/C3=C/C=C4/OCCCCCCCCCCCCCCCC(OCC(O)C3)c3cccccc4ccc3)C2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
458	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCN(C(=O)Cc2ccccc2)CC1)C1CCCCCCCC(=O)N1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
459	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCN(C(=O)CCc2ccccc2)CC1)C(=O)O	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
460	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCN(C(=O)C(C)C)CC1)C(=O)N1CCCCC1C(=O)NC(Cc1ccccc1)C(=O)O	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
461	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCN(C(=O)c2ccc3ccccc3c2)CC1)C(=O)O	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
462	COc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(NC(=O)N3CCC(C(=O)O)CCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)NS3(=O)=O)CC2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
463	CC(C)Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(N3CCCC3CNS(=O)(=O)/C3=C/C=C(/c4ccccc4O)OCCCCCCCCCCCCCCCC3O)C2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
464	COc1ccc(S(=O)(=O)N2CC3CCC2C2CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCO/C(c4ccc(O)cc4)=C\C=C(\CC(=O)NCC(O)CO2)S(=O)(=O)N3)cc1OC	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
465	CC(C)Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(N3CCCC3CNS(=O)(=O)/C3=C/C=C(/c4ccc(F)cc4)OCCCCCCCCCCCCCCCC3O)C2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

451 to 465 of 73725 items. Total 4915 pages.