Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
511	CC(C)Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(N3CCCC3CNS(=O)(=O)/C3=C/C=C(/c4cccc(N)n4)OCCCCCCCCCCCCCCCC3O)C2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
512	CC(C)Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(N3CCCC3CNS(=O)(=O)/C3=C/C=C(/c4cccc(O)c4)OCCCCCCCCCCCCCCCC3O)C2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
513	CC(C)Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(N3C=CCC3CNS(=O)(=O)/C3=C/C=C(/c4cccc(F)c4)OCCCCCCCCCCCCCCCC3O)C2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
514	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCN(C(=O)C2CCCCC2)CC1)C(=O)NC(Cc1ccccc1)C(=O)O	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
515	COc1ccc(S(=O)(=O)N2CCC(N3CCCCC3=O)CC2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
516	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCN(C(=O)C2CCCCC3(CC3)C2)CC1)C(=O)O	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
517	CC(C)COc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(N3CCCCC3)CC2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
518	CC(C)Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(N3CCCC3CNS(=O)(=O)/C3=C/C=C4/OCCCCCCCCCCCCCCCC(COCC(O)C3)c3cccccc4ccc3)C2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
519	COc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(NC(=O)N3CCC4(CCCC4)OCc4ccc(O)cc43)CC2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
520	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCN(C(=O)C(C)C)CC1)C(=O)N1CCC(C(=O)O)CC1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
521	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCN(C(=O)C2CCCC2)CC1)C(=O)O	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
522	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCN(C(=O)c2cccc(-c3nnn[nH]3)c2)CC1)C1CCCC1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
523	CC(C)Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(N3CCCC3CNS(=O)(=O)/C3=C/C=C(/c4ccc(Cl)cc4)OCCCCCCCCCCCCCCCC3O)C2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
524	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C1CCN(C(=O)c2cccc(-n3nnnn3)c2)CC1)C1CCCC1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
525	COc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(N3CCC(C(=O)O)CCC(=O)NCCCCCCCCCCCCSC(=N)NC3=O)CC2)cc1	AlphaDrug	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

511 to 525 of 73725 items. Total 4915 pages.