Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
48061	COC1=C2C(c3ccc4c(c3)OCC(C)O4)=CN=C2C(C(=O)O)=NC1	Pocket2Mol	4KEU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
48062	OCc1c(O)cc2c3c1OCc1ccc4nc5c(c(c4c1-3)O2)CC(O)=CC5	Pocket2Mol	4KEU	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
48063	Cc1ccc(-c2cc3c(cc2O)Oc2cc(O)cnc2O3)cc1	Pocket2Mol	4KEU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
48064	CC(C)(CCCc1c(O)ccc2ccccc12)CC(=O)O	Pocket2Mol	4KEU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
48065	OC1=C=CC2=C3CC=Cc4cc5c(c(c43)OC2=C1)CC=C(O)C5	Pocket2Mol	4KEU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
48066	O=C1Cc2c[nH]nc2C=C1c1ccc(Oc2cccnc2)cc1	Pocket2Mol	4KEU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
48067	O=C(O)C1=NC=C(c2ccc3c(c2)Oc2ccccc2C3)C1	Pocket2Mol	4KEU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
48068	CC1=CCC(c2cc3c(cc2O)Oc2cc(O)ncc2C3)=C1	Pocket2Mol	4KEU	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
48069	Cc1ccc(-c2cc3c(cc2O)Oc2cc(O)cnc2C3)cn1	Pocket2Mol	4KEU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
48070	O=C(O)c1cc2c(cc1O)Oc1c3c(nc4cccc-2c14)CC(O)(O)CC3	Pocket2Mol	4KEU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
48071	O=C(O)c1ccc2oc3c(cc(F)c4ccc(O)cc43)c(=O)c2c1	Pocket2Mol	4KEU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
48072	CC(C)C=c1nc2c3c(c4c(oc1=3)=CC(O)=C(C(=O)O)C4)CC=C2	Pocket2Mol	4KEU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
48073	Cc1ccc(-c2cc3c(cc2O)OC2=CC(O)=NCC2=C3)cc1	Pocket2Mol	4KEU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
48074	COc1cc(CCNC(C)=O)cc2c1OCC1C2CC2C(=O)CCCN21	Pocket2Mol	4KEU	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
48075	COC1=CCC(=O)C(c2ccc(Oc3cccnc3O)cc2)=C1	Pocket2Mol	4KEU	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

48061 to 48075 of 73725 items. Total 4915 pages.