Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
64711	CCN(CN1C=C=CNC(CNC[C@@H](C)C(C)C)=C=C1C(C)C)N=C1CC=CNC=N1	TargetDiff	6FNI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64712	COC1=CCC=C(CCC2CN/C3=N\CCC4CCc5nc6ccccc6c(c54)C3CC3CCCCC23)N1	TargetDiff	6FNI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64713	OCC1COC2CC1(C1(COF)CCC(CC3=C4CC(O)CC4CC3)CC1)CC1Cc3c(ccnc3C(CF)CC1O)C=C=C1C=C(O)C=CC12	TargetDiff	6FNI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
64714	NC(=O)OC=C1C=C(N[C@H]2C=NNC=CC2Cl)C=CC1	TargetDiff	6FNI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64715	CCCCC1(O)CC2(OC1=O)C1=CC=CC=CC1CC2O	TargetDiff	4U71	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64716	CC(C)CO.CC1C=CC=C(F)C1C(S)C(O)(O)COP(=O)(O)O	TargetDiff	4U71	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64717	CC1(O)CCC(CC(O)C(CC2=C(OP([O])[O])CC=CC2)C(O)(O)CO)C1	TargetDiff	4U71	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64718	CCN=CCC[C@H](CO)[C@@H](C(=O)O)[C@@H]1CC[C@@H](O)[C@H](O)[C@@]1(CCC(F)(F)COCC(=O)O)C[C@H](O)[C@H](O)C(=O)O	TargetDiff	4U71	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
64719	CC(=O)NCC(O)(O)C(CC(N)C(O)(O)F)C(CO)C1C=CC=CC=C1	TargetDiff	4U71	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64720	O=[P](O)C(NCC1CCOCC1)C(O)(O)NC1=CCC=CC1	TargetDiff	4U71	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64721	CCC1C=C(CC=C=C2CCN(C)N2)CC(F)C1C(O)P(=O)(O)C(CCOC)CC(=O)O	TargetDiff	4U71	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64722	O=C(O)C(O)CC(O)(O)C1(O)COC2CC=CCC2C(CO)C1	TargetDiff	4U71	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64723	C[C@H]1C[C@@H]2CC[C@@H](C)[C@@]1(C(O)=C(O)[P](=O)NO)CC2	TargetDiff	4U71	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
64724	NC(=O)CN1CC2=NCN=C3C2=C1c1ccc(F)cc13	TargetDiff	7LKX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64725	O=C1N2OCOCCC(O)C2CC12C=CCC=C2	TargetDiff	7LKX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

64711 to 64725 of 73725 items. Total 4915 pages.