Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
6631	CC(C)(N)CNC(=O)c1ccc(-c2cc(NC(=O)NCc3cccc(-c4nccnn4)c3)ccn2)cc1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6632	Cc1ccc(-c2cccc(CNC(=O)Nc3cnnc(-c4ccc(C(=O)NCC(C)(C)N)cc4)c3)c2)cc1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6633	CC(C)(N)CNC(=O)c1ccc(C2=CCN(C(=O)c3ccc4ccccc4c3)CC2)cc1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6634	CC(C)(N)CNC(=O)c1ccc(-c2cc(NC(=O)NCc3cccc(-c4ccc5nccn5c4)c3)ccn2)cc1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6635	CC(=O)Nc1cc2cc(-c3cnn(-c4ccc(C(C)(C)N)cc4)c3)ccc2cn1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6636	CC(C)(N)CNC(=O)c1cc2cc(-c3ccc(-c4cccc(C(F)(F)F)c4)cc3)cnc2cc1OCCCN	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6637	CC(C)(N)CNC(=O)c1ccc(C2=C3\C=CC(OC(=O)Nc4ccccc4)=CC=C3C3CCN(CC3)C(=O)N/C(c3ccccc3)=C\2)cc1	AlphaDrug	4NSB	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6638	CC(C)(N)/C=N/C(=O)c1ccc(-c2cc(Nc3cnnc(N4CCCC4)n3)cc(C(F)(F)F)c2)cc1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6639	CC(C)(N)CNC(=O)c1ccc(-c2cc(NC(=O)NCc3cccc(-c4cscn4)c3)ccn2)cc1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6640	Cc1c(C(=O)Nc2cccc(-c3cccc(S(C)(=O)=O)c3)c2)cc(-c2ccccc2)n1C(C)C	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6641	CC(C)(N)CNC(=O)c1ccc(-c2cc(NC(=O)NC(Cc3ccccc3)C(C)(C)C)ccn2)cc1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6642	CC(C)(C)NC(=O)N1CCC(Oc2ccc(C(=O)Nc3cccc(-c4cccc(S(C)(=O)=O)c4)c3)cn2)CC1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6643	CC(C)(N)CNC(=O)c1cc2cc(NC(=O)NCc3ccccc3)ccc2n1Cc1ccccc1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6644	CC(C)(N)CNC(=O)c1ccc(-c2cc(NC(=O)N3CCC(N4CCCC4)CC3)cc(C(F)(F)F)c2)cc1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6645	Cn1nnnc1-c1cccc(CNC(=O)Nc2ccnc(-c3ccc(C(=O)NCC(C)(C)N)cc3)c2)c1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

6631 to 6645 of 73725 items. Total 4915 pages.