Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
6676	CC(C)(N)c1ccc(-c2ccc3ccc(NC(=O)N4CCN(c5ccc6ccccc6c5)CC4)cc3c2)cc1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6677	CC(C)(N)CNC(=O)c1ccc(NC(=O)N2CCC(OCc3cccc(-c4nnc(-c5ccccc5)o4)c3)CC2)cc1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6678	CC(C)(N)COC(=O)N1CCC(Oc2ccc(C(=O)Nc3cccc(-c4cccc(S(C)(=O)=O)c4)c3)cn2)CC1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6679	Cn1c(N)nnc1-c1cccc(CNC(=O)Nc2ccnc(-c3ccc(C(=O)NCC(C)(C)N)cc3)c2)c1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6680	CC(C)(N)c1cc(-c2cccc(S(C)(=O)=O)c2)nc(N2CCC(OC(=O)NCCCCc3ccccc3)CC2)n1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6681	CC(C)(N)CNC(=O)c1ccc(-n2cnc3c(-c4cccc(S(C)(=O)=O)c4)cccc32)cc1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6682	CC(C)(N)CNC(=O)c1ccc(-c2cc(NC(=O)NCc3cccc(-c4ccccn4)c3)ccn2)cc1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6683	CC(C)(N)CNC(=O)c1ccc(-c2cc(NC(=O)NCc3cccc(-c4nnc(-c5ccccc5)o4)c3)ccn2)cc1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6684	CC(C)N1CCC(Nc2ccc(-c3cc4c(Cc5ccc(OC(F)(F)F)cc5)n[nH]c4cc3C(=O)NCCCN3CCOCC3)cn2)CC1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6685	CC(C)(N)CNC(=O)c1ccc(-c2cc(N3CCC(C(=O)NCCCc4ccccc4)CC3)ccn2)cc1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6686	CC(C)(N)CNC(=O)c1ccc(-c2cc(NC(=O)NCc3ccc(NC(=O)Nc4cccc(C(F)(F)F)c4)cc3)ccn2)cc1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6687	CC(C)(N)/C=N/C(=O)c1ccc(-c2ccoc2C(=O)Nc2cccc(C(F)(F)F)c2)cc1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6688	CC(C)(N)CNC(=O)c1ccc(NC(=O)N2CCC(Oc3ccc(C(F)(F)F)cc3)CC2)cc1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6689	CC(C)N1CCC(C(=O)Nc2cccc(-c3cc4c(Cc5ccccc5)n[nH]c4cc3F)c2)CC1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6690	Cn1nncc1-c1ccc(CNC(=O)Nc2ccnc(-c3ccc(C(=O)NCC(C)(C)N)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	4NSB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

6676 to 6690 of 73725 items. Total 4915 pages.