Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
66916	N=C(N)c1ccc(CC(N)O)cc1	TargetDiff	5MN1	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66917	CC(=O)O.C[C@H](O)[C@@H](C)C(O)=C1C=NC2=C=C(N=C(NCCO)CN2)N1	TargetDiff	5MN1	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66918	NC(N)=NC1=CCCCC=C1	TargetDiff	5MN1	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66919	CCN=c1ccc2c(cc1)C(=N)N=N2	TargetDiff	5MN1	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66920	N=C1NCC2=C1CC1=C2C=CC2N=CN=CC2=C1	TargetDiff	5MN1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66921	NC(=O)C1CCN(C2CCCC2)C=CN1	TargetDiff	5MN1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66922	CC1=NC(CNCC(N)=O)C=C2C3=CCC(F)=CC3CCC21	TargetDiff	5MN1	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66923	CC(O)C1(O)C(Cl)C2CS([O])([O])NC2C(=O)N(O)C1C	TargetDiff	5E2S	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66924	O=C(O)N1c2cc(C(F)(F)F)c(F)c(F)c2OC2CCC21	TargetDiff	5E2S	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66925	O=C1OC2C(C(O)(O)NO)=CC=C(F)C2C2COC(O)C12	TargetDiff	5E2S	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66926	CC(N)CC1CC(O)C(O)C2C(O)CC3C/C=C\CC2C(CC/C=C\S1([O])[O])C3	TargetDiff	5E2S	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66927	CC(C)(O)N(C(=O)C1CCC(O)C(O)C1O)C1=CC=CCC=C1	TargetDiff	5E2S	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66928	CC1C=CC(C(N)=O)=C2C(=O)N(O)C(=N)C3OC4OC(=O)C(C)C(O)(O)C4C3C21	TargetDiff	5E2S	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66929	CC(C)C1CCC23CC4CCC(OC(O)(O)c5cccc(c5)C(=O)OC12)C4C3	TargetDiff	5E2S	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66930	O=C1C(O)C2CCCC2C1C(F)(F)F	TargetDiff	5E2S	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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