Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
66961	CC1/C2=C\C(F)CCc3ccccc3NC3OCCC4C(CCC25C4CCCC5(C)O)C1CC(O)C3O	TargetDiff	5IHH	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66962	COC1=CC(C)C(O)C(c2ccccc2-c2cccc(N([O])[O])c2)C1C	TargetDiff	5IHH	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66963	CC(=O)C1C=CCCN1C(=O)Nc1ccccc1	TargetDiff	5IHH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66964	CC=CC1=CC[C@@H]([C@@H]2CCCOCC[C@@]2(C)C(C)=O)CC1C(=O)C1C=CCC=C1	TargetDiff	5IHH	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66965	CC1=C(C2C=C(CC3NC4=C(CC=CC4)C4=C3C=C(O)C(O)=CC4)CC(ON)=C2)CNO1	TargetDiff	5IHH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66966	CC[C@@H]1C(=O)NC=NC1=NC(C)=C1CC=C(F)C=C1Cl	TargetDiff	5IHH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66967	CCC(O)CC1OCC(C)C2COC(Cl)=C=C3C=C(O)CC=CC3CC1C1=CC=CC(C1)CC(C(N)=O)C(C)C2(C)F	TargetDiff	5IHH	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66968	O=C1C=C(O)C(CO)N2C(=O)N3c4ccccc4C(C4C=CCC(F)=C4)C3C2=N1	TargetDiff	5IHH	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66969	CCNC1CC2=NC3=C4C(=CNN3c3ccc(Cl)cc32)CC2=CCC=C1C24	TargetDiff	6QAV	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66970	CC1=CC=CC2C1=NC=NC1=CN(C)C(C3C=CCC(C)C(C)(C)N3)=CC12	TargetDiff	6QAV	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66971	OC1=CCC=C2NC3=C4C(=C12)/N=C/N/C=C/NCc1nnc2c(c14)C3OCC2	TargetDiff	6QAV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66972	CCCN=C1C=CCN2C(=C1)NC[C@H]1CC=C(/C(N)=C\CCc3cccc(c3)C2(O)O)N(CC)C1=O	TargetDiff	6QAV	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66973	CC1C2CN1CCNC1=CC(COC3=CC=CC(C=C3)c3ccncc32)C(Cl)=CC1	TargetDiff	6QAV	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66974	N=C1NC2=C3NNC4=CC=CN=C5N=CC6C(=C(NN6c6ccccc6)C3CC2N1)C45	TargetDiff	6QAV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66975	CC1=C(O)C2N=C(N3C(=O)NC4=NCC(CN)=CC43)CC(O)C(O)C2C(N)CO1	TargetDiff	6QAV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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