Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
68341	NCCNC(=O)N(NC(=O)CNCCO)C(C1=CC=C(O)CC1)c1ccc(Cl)cc1	TargetDiff	6MQE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68342	CC1N=C2OCC(c3ccc(O)cc3)S(O)(O)NC2=NC1=O	TargetDiff	5D7N	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68343	NC(=O)OC1C=CC(CC(=O)O)C=C1	TargetDiff	5D7N	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68344	C=C1C2=NC(=S)N=CC2CN1CC1CN2C=C(O)CC3=C2N(C1)NN3	TargetDiff	5D7N	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68345	NC(=O)C(O)C(C1=NC2CCCC23CC(Cc2cccc(N)c2)CN13)c1ccccc1	TargetDiff	5D7N	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68346	CC1CCC(CCC2=CC3=C(OC(=O)C3O)C(C(=O)O)C2C(C)O)N1	TargetDiff	5D7N	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68347	CC(CCC(N)=S)C1=NC=CC(CC(N)=O)C=C1	TargetDiff	5D7N	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68348	CC(C1=C2CC(CNCC(=O)O)C(CC3C=CC(Cl)C=C3)=C2N(C)C1=O)S(O)(O)S	TargetDiff	5D7N	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68349	CC(O)(O)NC(=O)C1C(O)COC1C(O)C1CCCC(F)CC1	TargetDiff	5D7N	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68350	COC1N=C(C2CC(C)NCC(c3cncc(O)c3CO)C2=O)C=NC1=N	TargetDiff	5D7N	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68351	CC(C)C(OC(C)(O)C1=CCC(O)=CC1)C1=CC=CC(C(=O)O)C1O	TargetDiff	5D7N	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68352	O=C(NO)C1C(O)N(C(=S)NC2=Nc3ccc(Cl)cc3C2)S(O)(O)N1c1ccccc1	TargetDiff	5D7N	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68353	CCCCCN(O)C(=O)c1ccc(CC(N)=O)cc1	TargetDiff	5D7N	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68354	CNC1=CCC(OC2=CCC=C3NC(C)(O)C=C4NNC2=C43)=CC1	TargetDiff	5D7N	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68355	CCOCc1ccc(OC(NCO)C2=C(O)C(O)(OC)C=CC2)cc1	TargetDiff	5D7N	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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