Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
69061	CC1=CCC=C(O)C1NNC1C(=O)N(C2=NC3=CC(F)CC=C3C2)C2=CC=CCC=C21	TargetDiff	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69062	CC1=NC(C(C)=C2CCN(c3ccccc3)CO2)C=C(OCN2C(=O)Cc3cnccc32)C1	TargetDiff	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69063	CC(CN(CCO)C(=O)NC1C(=O)c2cnccc21)NC(CCO)c1cnc2ccccc2n1	TargetDiff	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69064	Cc1ccc2c(=N)ncc(C3CN4C=Nc5c(CF)ncnc5C4=CC4CC=CC=C43)nc2n1	TargetDiff	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69065	CC(Cc1cccnc1)C(O)C(C(=O)O)C(CCNCC(O)CCCO)Cc1ccccc1	TargetDiff	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69066	NC(CC1OC(c2ccc3ccc(Cl)cc3c2)C2C1=CCC(O)=C2F)c1ccc(O)cc1O	TargetDiff	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69067	CC(=O)CC1CC2CC(O)(C3=C(C(N)=O)CC(NC4=CC=C(F)CC=C4)C3)C(C)C=C2C1C	TargetDiff	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69068	NC(=O)c1ccc(NC(=O)NC2CNC(Nc3ccccc3)=NC2=S)nc1	TargetDiff	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69069	CC1C2CC(CC3C4C=NCNC=C4OC3(O)O)OC3(O)C1C(CC(O)C2O)C1CC(C2(C)CC4=C(C2)NCC4)C1C3(O)O	TargetDiff	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69070	Cc1ccc(C(=O)C2Cc3ccccc3C2(O)C(=O)Nc2ccc(F)cc2O)cc1	TargetDiff	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69071	COC1C2=C(CC=CC2)CC(=O)C1C1OC2=C(O1)C1C(=O)N(C3COCCC(c4cnccn4)O3)CC1OC1C=CCCC21	TargetDiff	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69072	CC(C)(Cc1ccccc1)c1cccc(C2NC3=C(CCC3)C(C(=O)O)C2O)c1	TargetDiff	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69073	O=C1c2cc(F)ccc2Cc2c1nc(=O)n1c3c(oc21)C1C=C(F)C=CC1C(CC(O)C1C(=O)OC2COCCC21)O3	TargetDiff	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69074	Cc1cc(F)cc(CO)c1Nc1oc(NC(C)(O)c2ccc(C3=NNCN3)s2)c2c1CCC2	TargetDiff	4TOS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69075	CC1=C2CC=C(CC(c3ccc(O)cc3)C3C=CC(Nc4ccccc4)OC3=O)N=C2C(O)=CC=C1	TargetDiff	4TOS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

69061 to 69075 of 73725 items. Total 4915 pages.