Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
69001	C[C@H](N[C@H]1[C@@H](O)CC(=C2NNC3=NC(=N)N=C32)[C@H]1C)c1ccccc1	TargetDiff	5EFJ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69002	CC(c1cccc(C(N)=O)c1)C1OC(C2NC(F)(C(=O)O)C2(O)O)O1	TargetDiff	5EFJ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69003	O=C1O/N=C2/NC(=O)c3ccc(cc32)CC2CC1=NC(=O)C(C(=O)O)C2O.Oc1cccc(F)c1	TargetDiff	6H33	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69004	CCC(O)(O)CCOC(=O)C(O)C1C(=O)CC(C)C2CC3CCCC3C(C(F)(CC(O)C(C)(C)O)C(=O)O)CC2C1O	TargetDiff	6H33	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69005	CC1C=C(F)C2=NC(c3ccc(S(O)(O)O)cc3)C(=O)N=C2C1C	TargetDiff	6H33	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69006	CC1CCC2(CC3CCOC(O)C(C)O3)C(C)CCC(C(C)(O)O)CC2C1	TargetDiff	6H33	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69007	CCNS([O])([O])c1cccc(C2CN(C(=O)O)CCO2)c1	TargetDiff	6H33	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69008	CN(CNOP(N)(=O)O)C(C(=O)O)c1ccc(Cl)cc1	TargetDiff	6H33	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69009	COC1CC2CC(O)C3C4=CC(C)(C)C(C)=CC4C(C2)C(O)C3CC2(C)C(O1)C(O)C(O)C(O)C(C)NC(=O)C2(C)C	TargetDiff	6H33	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69010	CCC(CCC(=O)C1C2CCC(NC(N)=O)=C2c2oc(=O)oc2C1CO)C(C)(C)O	TargetDiff	6H33	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69011	C[C@@H]1NC(=C[C@@H]2CCC[C@@H](C)C2=O)CC1[C@@H](c1cccc(S(O)(O)O)c1)N(O)CO	TargetDiff	6H33	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69012	CC(CC1CCC1O)CC1(O)C=C(CO)CC=C1C(=O)O	TargetDiff	4QEV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69013	CC1CCC2CCC(C)C2C2C1CC1C3=C(CC(=O)C1C2CO)CC1=C(CCN=C1)O3	TargetDiff	4QEV	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69014	O=C(O)N=C1C=CC(F)C[C@H]2C3=C4CCCC4C(=O)[C@]3([C@H]3CCC4=C(CCC4)N3)OC(=O)C12	TargetDiff	4QEV	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69015	CCOc1ncc(C)cc1C(CC)(NC(C)(O)O)OC1CCCCO1	TargetDiff	4QEV	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

69001 to 69015 of 73725 items. Total 4915 pages.