Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
69391	FC(F)(F)C1CC2=C(C1)CN(C1=NC=NCC1)CC2	TargetDiff	5WUK	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69392	O=C(O)C1=C=CC(F)C2=C(/C=C\1)OC(OC1=C(O)CCN1)CC2F	TargetDiff	5WUK	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69393	FC1=CC2C(OCC3C=C4N=CCN=C4CC32)C(F)=C1	TargetDiff	5WUK	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69394	CCC(OC(S)C(=O)O)C(CO)C(O)C(O)O	TargetDiff	6ARM	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69395	O=P(O)(O)O.OC1CNC(C2(O)OCOC23COC(O)(O)C3O)O1	TargetDiff	6ARM	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69396	O=C(O)OC(=O)C(O)C(O)CO	TargetDiff	6ARM	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69397	NC(C(=O)O)C(O)C1OC(C(O)C(O)[P](=O)O)C(O)C1O.O=[P](O)O	TargetDiff	6ARM	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69398	O=C(OP(=O)(O)C(=O)O)C1CC(O)C(O)C1CO	TargetDiff	6ARM	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69399	NC(=O)C1(O)CC(P(=O)(O)O)C(OC(O)OO)C1O	TargetDiff	6ARM	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69400	O=P(O)(O)OC1OC(O)C(O)C1O	TargetDiff	6ARM	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69401	O=C(O)CCOP(=O)(O)O	TargetDiff	6ARM	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69402	O=C(O)C1OC2(O)COC(O)(C(O)C2)C1O.O=P(O)(O)O	TargetDiff	6ARM	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69403	O=C(O)C(COP(=O)(O)O)C(O)C(O)C(O)C(O)O	TargetDiff	6ARM	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69404	CC1=CC2NC(=N)CC(O)C3(OC(O)(C(=O)O)C3S(N)=O)C(O)C(=O)N3c4ccccc4C(=C1)C23	TargetDiff	5Y13	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69405	CC(=O)OC1CC(O)C(C(O)C(=O)O)N1C1OC(=O)C(C)CCC1C(O)C1C=CC(C(=O)O)=CC1	TargetDiff	5Y13	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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