Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
69436	N=C(F)NCSC1CCN(CC2C=CC3C=CCC=C3CC2c2ccccc2)C1	TargetDiff	5OH2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69437	CC1=CC2C(C)=CC=NC2=NC1=O	TargetDiff	5OH2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69438	O=C1CCN(CC(=O)NC2CC3=C(O)CC4CNC4=C32)C=N1	TargetDiff	5OH2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69439	COC1Cc2ccc(N=C3C=CC(CNCN)=C(C=N)C3)cc2O1	TargetDiff	5OH2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69440	NCCC1CN2NC(C3CCC4CCC(C(=O)O)CC4O3)CC2=N1	TargetDiff	5OH2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69441	CC1NC(=O)NC=C1c1ccc(C2=NC=CCN=C2)c(F)c1.NCN(N)O	TargetDiff	5OH2	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69442	CC1CC2C3=C(CCCC3)C2NCN1	TargetDiff	5OH2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69443	CC(CP(O)O)=NCC(CO)O[C@H](CO)COC[C@H](CCO)C[C@@H](O)C(C)(C)OP([O])[O]	TargetDiff	5BTV	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69444	CC(O)C(C)(O)CC1C2OCC3OC1C1(CO)COC(C(O)c4cc(Cl)ccc4S(O)(O)O)OCC(O)C1C32	TargetDiff	5BTV	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69445	O=C(CC1CCCCC1)NC(=O)OP(=O)(O)O.O=CC(O)C(O)(C(=O)O)N1CC2CNCNC3CCC1C23	TargetDiff	5BTV	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69446	CNC1OCC(O)(O)OC2COCC2C(C)OC(=O)CC(O)C(N)SC1C(O)C1CC2=C(CC3C=CCC(C(N)(O)O)=C3)CNC2=N1	TargetDiff	5BTV	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69447	CC1=C(C)C(S(C)([O])[O])C=CC1C(N)C(O)CNCC(=O)O.O=C1CC(P(=O)(O)O)OC2(C=CC=CC=C2)C(=O)N1	TargetDiff	5BTV	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69448	CCCC(O)C1CC(OC(=O)O)CC(C23C4CCC2C2CCCC2C3(O)COC4CC)O1	TargetDiff	5BTV	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69449	CC(O)CCC(CCCP(=O)(O)O)NC(=O)C(C)COc1cccc(C(O)C(O)C(=O)C(=O)O)c1	TargetDiff	5BTV	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69450	CC1CCN(C)C(=O)C(C(O)CC(C(=O)O)C2CCCCO2)CCO1	TargetDiff	5BTV	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

69436 to 69450 of 73725 items. Total 4915 pages.