Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
69466	CC1=C(F)C(C(=O)c2ccc(C)nc2)C(C(=O)NCO)=C1O	TargetDiff	5UMY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69467	Fc1ccc(C(F)F)cc1.c1ccc2c(N3CCN3)ccnc2c1	TargetDiff	5UMY	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69468	CCC1C(C)C(C)=NC2CC(O)c3ccccc3CCC21	TargetDiff	5UMY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69469	OC1CC(OC2=CCN=CC2)C(O)C1Cc1cccc(F)c1	TargetDiff	5UMY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69470	CC1CCC(Cl)(C2=c3ncncc3=CC2C2C=CN(C)N=C2)N1	TargetDiff	5UMY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69471	CCNS([O])([O])c1sc(Cl)c(Cl)c1N(OC)C(=O)C=C1C=NC(OC)=CC1	TargetDiff	5UMY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69472	O=C1NC2CNCCC2C2=CC=CC3CCC(C3=C2)N1O	TargetDiff	5AUT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69473	CCC1CCCC2=C1c1ccc(O)cc1N1CCC(CN)=C21	TargetDiff	5AUT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69474	CCC1(C)C(=O)C2C3NC(=O)C4=C3C3=CC(=CC=CC3S4)CC3C=CC(C)C(=C3)C2C1C	TargetDiff	5AUT	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69475	NC(=O)C1NN2CCNN=C3C2=C1CC(=Nc1ccccc1)[C@H]3O	TargetDiff	5AUT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69476	N#CC1=CCC2=NC3=C(NNCO)OC4C=CC(=N)C5CCC(=C45)N3CC=C2C1	TargetDiff	5AUT	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69477	CC1C(=O)NC(=O)C2c3cccc(c3)C3=CC=NC4=NC=CN(C4=C3)C3C=CNN=C3NNC12	TargetDiff	5AUT	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69478	NC(=O)C1CCC2=NCC3C4=C5c6cc(ccc6NN5CC4)S([O])([O])COC(C1)N23	TargetDiff	5AUT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69479	CC(=CO)[C@@H](CCC(O)(O)[C@@H]1C[C@@H](C)C[C@@H]1CC(=O)O)[C@@H](C)O[C@@H](O)CO	TargetDiff	5NWI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69480	CC(=N)C(O)(O)C1CC(O)(O)C(O)C2C(O)C3C(CC(O)C(=O)O)C4C(C)C=NCN4C3OC3CCC4C=CC=C1C4C32	TargetDiff	5NWI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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