Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
69496	CC(C)c1cnccc1O	TargetDiff	5CQT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69497	CC(C)OC1=CC2CC(C=N)C3=C(NC4CCCC(C4)C3=O)C2C=C1	TargetDiff	5CQT	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69498	C=CN.Cc1cncc(C2CCCCC2C2CCCOCC2)c1	TargetDiff	5XPI	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69499	CNC1CCC(CC2CCC3CCCCC32)C1.O=C(O)C1CC(O)CN1	TargetDiff	5XPI	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
69500	CC(=O)C(C)NC(=O)C1CCOC1.OC1Cc2ccccc2Cc2c(F)cccc21	TargetDiff	5XPI	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69501	CCNCCC(F)F.OC[C@H](O)[C@@H]1C[C@@H](CCC2C=CCC=C2)[C@@H](C=C2CNN(F)[C@H]2F)[C@@H]1O	TargetDiff	5XPI	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69502	CC(O)C(=O)NC1NC2CC(C(C)C(C)(C)CF)C(O)C(O)C21	TargetDiff	5XPI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69503	CC1(O)CCC(Nc2c3n(c4cc(CO)ccc24)CCCC3)C1.CCCCOCCO	TargetDiff	5XPI	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69504	O=C1CC(CO)C(CCO)O1.OC1CC(C(O)(O)CCC2OC(F)CS2)C1(O)CCF	TargetDiff	5XPI	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69505	C[C@H](O)[C@@H](C=CO[C@@H](C=S)CO)N1CCC[C@@H]2[C@@H]1CC2(O)O.O=C(O)NCCC1C=CCC=C1	TargetDiff	5XPI	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69506	C=C(CCOCC(O)C(CO)C(CCOC)NCCO)NCC	TargetDiff	5XPI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69507	O=C1CC2=C(O)C=C(NC(=O)C3CC4=C(C(CCO)O3)C3NC(=O)OC3=C4F)CC3CCCC(=N1)N23	TargetDiff	5VL2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69508	COc1cccc(CN2CC3=C(NCN3)N2)c1	TargetDiff	5VL2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69509	CC(N)=O.COc1cccc(C(=O)Cc2ccc(C3CCCCO3)cc2)c1	TargetDiff	5VL2	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69510	CC1C=CCC(=C(O)C[C@H]2CN(CO)NN2)C=C1	TargetDiff	5VL2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

69496 to 69510 of 73725 items. Total 4915 pages.