Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
70051	CCCCC1=C2C(=CNN=C3C(=N)NCC32)C(c2ccccc2)N1	TargetDiff	6UEG	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70052	CCC12CCC(CC(C)C(O)C3C4=C(CC(C)=CC4)CC3CC3CCC(C)CC3O)CC(CC(C)C1)O2	TargetDiff	5FYX	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70053	COC1c2ccc(F)cc2C2C(C)C3OCC(O)C(C(CO)C(C)CO)C34OC3=CC(F)C(C(F)F)C=C3C124	TargetDiff	5FYX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70054	CCC1CCCCN(C2=NCN(C(C)CC)C2)CCCC(O)C(C)(O)CCOC(=O)C(C)CC(CO)OC1	TargetDiff	5FYX	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70055	CC1CC2C(C)CC3CC2C1CCC1C(C)C2CCCCC2C(C(=O)O)C1C1(C)CCCC1C3O	TargetDiff	5FYX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70056	CC1NC[C@H](O)c2cc(F)ccc2N2CCC(=O)OC3=CC(=CO)[C@@H](O)C=C3O[C@H](C)OC(=O)C(C)[C@H]1CC2	TargetDiff	5FYX	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70057	CC(CN(C)c1cccnc1)C1C=C(C(=O)Cc2cccc(CF)c2)C2CCCCC2CC1	TargetDiff	5FYX	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70058	CCC(c1ccccc1)N1C(=O)C(C)C(c2ccccc2)C1=O	TargetDiff	5FYX	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70059	CCC(C)CC1NC2/C=C\C(c3cccc(F)c3)C#CCC3C=CCC=C3C2(O)CO1	TargetDiff	5FYX	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70060	CCC[C@H](C)[C@H](C)C[C@H](C)O[C@@H]1C=CC(=CNO)C=C1[C@H]1C[C@H](C)CCC[C@@H]1C[C@H]1N[C@@H](C)[C@@H](C)O1	TargetDiff	5FYX	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70061	ClC1CNC2=C(C=CCC2)C1	TargetDiff	4UYE	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70062	CC(=O)N=C1CC2=C3[C@H](O2)[C@H]2C(=N)CC=C[C@@H]2NC[C@@H]2[C@@H](C(O)(F)F)CC[C@H]2[C@@H]13	TargetDiff	4UYE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70063	CCC1C=CCC=C1O	TargetDiff	4UYE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70064	Cc1cc2c(c(C)c1O)c(=O)oc1ccccc12	TargetDiff	4UYE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70065	CC1C(=N)N=C2CC(=N)NN2C1=O	TargetDiff	4UYE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

70051 to 70065 of 73725 items. Total 4915 pages.