Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
71176	CC1=C(CCC(C)O)SCC1.CCC1CC2(C)C(CC1C)C(NC(=O)C(N(C)C(C)C)P(=O)(O)O)=C1C=NN=CC1C2(O)O	TargetDiff	3WGG	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71177	CCCCCC(C)C1CC2=C(C1)C(CO)NC1=CCC(C(N)=O)=CC3=C1CC(S(O)(O)OC)(C=C3)c1cccc(c1)C(C(=O)O)O2	TargetDiff	3WGG	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71178	NC1=C[C@@H](N)C(CCC(=O)NC(=NCC(=O)Nc2ccncc2)C(=O)O)=CC1	TargetDiff	3WGG	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71179	Cc1ccc(NCC2C=C(C3C(=O)CCC(C)CC3=O)CC(C)C2)cc1.OC1CCC1C1NC2Cc3ccccc3C21	TargetDiff	3WGG	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71180	CCC1CC(O)(C(C)(O)C2NCC(OC(=O)OC)CC2C(=O)O)CC(C)C1C	TargetDiff	3WGG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71181	CCC1C(=O)[C@H]([C@H]2C[C@H]3CC[C@@H]2C[C@](O)(F)C3)C(=O)[C@H]1C=C(C)[C@H](O)[C@H](CCCOCCC(=O)O)[C@@H]1CC(O)(O)CC(=O)O1	TargetDiff	3WGG	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71182	C[C@@]1(O)NC2=C3C=CC(=NC=Cc4cccc(C[C@@H]5N[C@@H](CO)[C@@H](C(=O)O)CO5)c4)N=C3COC2N1.NC(=O)Cc1ccccc1	TargetDiff	3WGG	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71183	CCOCC1=CC(C(=O)N[C@H](C)[C@H]2CC(=NC)C3=C2N=CC2[C@@H]3C(=O)CC23C=CCC=C3)[C@H]([C@H](O)[C@@H](O)C(C)C)C=C1	TargetDiff	3WGG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71184	COC1=C2CC(O)(OC(=O)C3C=C4NNCN4C(=O)C=N3)CC2N=C1N(C)c1cnccn1	TargetDiff	6N5X	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71185	OC12CCC3C1NC(C2)C3(O)O	TargetDiff	6N5X	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71186	OC1CC(O)C2CCCC2C(O)C1O	TargetDiff	6N5X	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71187	O=C(O)C1C=CC2C=CC=CC2=C1	TargetDiff	6N5X	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71188	OCC1CCC(O)C(CO)OC1O	TargetDiff	6N5X	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71189	OCc1cc(O)c(Cl)cn1	TargetDiff	6N5X	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71190	CCC(=O)O	TargetDiff	6N5X	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

71176 to 71190 of 73725 items. Total 4915 pages.