Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
71206	CCCNC(=O)OC(C)CNC1=NOC(F)O1.O=C1N/C=C\CCN(c2ccccc2)/C=C2/CCCC2C2CCC(C2)C2CC=CC=C12	TargetDiff	5JY3	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71207	CCC(=O)NC1=CC(=NCN(C)c2ccccc2C2C=CCC=C2C)NCC(F)=C1	TargetDiff	5JY3	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71208	CN(c1ccc(O)cc1C(=O)O)C1CC2OC(C)(O)CC3CCCC32C1F	TargetDiff	5JY3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71209	CC1CCOc2c(C(=O)O)cc(C3=C=CC(C(C)(C)O)c4cccc(F)c4N3)c(F)c2O1	TargetDiff	5JY3	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71210	NS([O])([O])C1CC2C(=C1C(=O)O)NC1OC(=O)N3CCC(CO)C=CC3=C12.OC1=CCC=CC1	TargetDiff	5JY3	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71211	C1CCOC1.O=C(O)C1=C(Cc2ccccc2)C(=O)C(C2=CC(C3CCCC(O)C3O)C(F)C(C(F)F)C=C2)C1	TargetDiff	5JY3	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71212	CCCCCOC1C=CC2C(=C1)c1cc(O)ccc1CC2C(=O)NC(O)C(O)C1=CCC(F)=CC1C	TargetDiff	5JY3	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71213	O=C(O)C1OC2C(CO)OC([P](=O)O)OCc3c(ncnc3C(O)C(O)C(=O)O)CN2C1=O	TargetDiff	5CBR	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71214	CCC1CCC(OCC(=O)O)C(C(C)=O)C(C2CC(O)C(O)C2O)O1	TargetDiff	5CBR	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71215	O=C(O)CCCCNC(=O)C(O)C(=O)N(Cl)C1CC(=O)N(COC(=O)C2=CC=CCCC2)C1	TargetDiff	5CBR	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71216	CC(CCC1CCOCC1CO)C1CCC(C(=O)O)NOCC(CO)C(O)C(C)COC(C(=O)O)CCC1=O	TargetDiff	5CBR	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71217	CC1=C=C2CC=CC3=C2C2/C(=[C]/C(=O)NNC(=O)NC4(O)N(C)C(=O)C1N4CC2C)N=C3	TargetDiff	5CBR	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71218	CCC[C@@H](C=C(O)CO)CC[C@H](CCCOCOC)NC(=O)CO	TargetDiff	5CBR	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71219	CCC1CCNC(=O)CC(O)CCCONCC(NCC2C=CC=CC=C2F)C(C(O)C(=O)O)CN1	TargetDiff	5CBR	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71220	CC1C=C2NCC(CO)NC(CN(C(=O)O)C(=O)[C]=C3C=CCC=C3)/C3=C/C2C(=C1)c1ccc(O)c(c1)C3=O	TargetDiff	5CBR	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

71206 to 71220 of 73725 items. Total 4915 pages.