Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
10501	COc1ccc(-c2nnc(-c3ccc(C(=O)N4CCC(NC(=O)Cc5ccccc5)CC4)cc3Cl)o2)c(OC)c1	AlphaDrug	4NJA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10502	COc1ccc(-c2nc(-c3cccc(C(=O)N4CCC5(CC4)CCN(C(=O)c4ccc(F)cc4)C5)c3)cs2)c(C(N)=O)c1	AlphaDrug	4NJA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10503	COc1ccc(-c2nc(-c3cccc(C(=O)N4CCC5(CC4)CNC5=O)c3)cs2)c(OC2CCN(C(=O)C(C)C)CC2)c1	AlphaDrug	4NJA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10504	COc1ccc(-c2nc(-c3cccc(C(N)=O)c3)cs2)c(-c2ccc3ccccc3c2)c1	AlphaDrug	4NJA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10505	COc1ccc(-c2nc(-c3cccc(C(N)=O)c3)cs2)c(-c2cccc3ccncc23)c1	AlphaDrug	4NJA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10506	COc1ccc(-c2nc(-c3cccc(C4CCN(C(=O)c5ccc6ccccc6c5)CC4)c3)cs2)c(OC)c1	AlphaDrug	4NJA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10507	COc1ccc(-c2nc(-c3ccns3)cs2)c(C(=O)NCC(=O)N2CCN(c3cccc4ccccc34)CC2)c1	AlphaDrug	4NJA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10508	COc1ccc(-c2nc(-c3cccc(C(F)(F)F)c3)cs2)c(C(=O)NCC(=O)N2CC=C(N3CC(=O)NC(C(N)=O)C3)CC2)c1	AlphaDrug	4NJA	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10509	COc1ccc(-c2nc(-c3cccc(C(N)=O)c3)cs2)c(C2CCN(C(=O)c3cccc4cnnn34)C2)c1	AlphaDrug	4NJA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10510	CC12OC(CC1(O)CO)n1c3ccccc3c3c4c(c5c6ccccc6n2c5c31)C(=O)NCCNC4=O	AlphaDrug	4O0Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10511	CC12OC(CC1(O)CO)n1c3ccccc3c3c4c(c5c6ccccc6n2c5c31)C(=O)NCCNC4=O	AlphaDrug	4O0Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10512	CC12OC(n3c(=O)[nH]c4cc(-c5cccc(Cl)c5)cc(-c5ccccc5)c4c3=O)CC1(O)COC1CCCC12	AlphaDrug	4O0Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10513	COc1ccc(-c2nc(N3CCCC3)cc3cnc(N4CCOCC4)nc23)cc1	AlphaDrug	4O0Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10514	CC1(C)CCC(Nc2nc(NC3CCN(c4ccc(Cl)cc4Cl)CC3)cnc2Cl)CC1	AlphaDrug	4O0Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10515	CC(C)(C)c1ccc(-c2cc(NC(=O)NC3CCCN(c4cccc(Cl)c4)C3)cnc2O)cc1	AlphaDrug	4O0Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

10501 to 10515 of 73725 items. Total 4915 pages.