Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
10516	CC12OC(CC1(O)CO)n1c3ccccc3c3c4c(c5c6ccccc6n2c5c31)C(=O)NCCNC4=O	AlphaDrug	4O0Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10517	CC1CN(c2ccc(Nc3nccc(-c4ccccc4)n3)cc2)CC(C(F)(F)F)O1	AlphaDrug	4O0Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10518	COc1nc(C(F)(F)F)c(NC2CCC(C3(C)CCC(O)C3)CC2)nc1N	AlphaDrug	4O0Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10519	CC12OC(CC1(O)CO)n1c3ccccc3c3c4c(c5c6ccccc6n2c5c31)C=NC4=O	AlphaDrug	4O0Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10520	Cc1cc(Nc2nc(C(=O)NC3CCC(C)CC3)cc(-c3ccc(C#N)c4nc(N)ncc34)n2)ccc1F	AlphaDrug	6G38	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10521	CC1CCC(C(=O)Nc2cc(-c3cccc(C(F)(F)F)c3)ccc2Nc2ncnc(Nc3ccc(C(F)(F)F)cc3)n2)CC1	AlphaDrug	6G38	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10522	CC1CCC(NC(=O)c2cc(-c3ccc(-c4ccccc4)cc3)nc(Nc3cccc(S(C)(=O)=O)c3)n2)CC1	AlphaDrug	6G38	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10523	CC1CCC(NC(=O)c2cc(-c3cc(F)cc(F)c3)nc(Nc3ccc(N4CCOCC4)cc3F)n2)CC1	AlphaDrug	6G38	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10524	Cc1cc(Nc2nc(C(=O)NC3CCC(C)CC3)cc(-c3cccc(C(C)(C)C)c3)n2)ccc1F	AlphaDrug	6G38	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10525	CC1CCC(NC(=O)c2cc(-c3cccc(C(F)(F)F)c3)nc(Nc3ccc(-c4ccccc4)cc3)n2)CC1	AlphaDrug	6G38	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10526	Cc1cc(Nc2nc(C(=O)NC3CCC(C)CC3)cc(-c3ccc(-c4ccc(F)cc4)c4ccc(F)cc34)n2)ccc1F	AlphaDrug	6G38	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10527	Cc1cc(Nc2nc(C(=O)NC3CCC(C)CC3)cc(-c3ccc(-c4cnccn4)c4cccnc34)n2)ccc1F	AlphaDrug	6G38	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10528	Cc1cc(Nc2nc(C(=O)NC3CCC(C)CC3)cc(-c3ccc(-n4ncc(C(C)(C)C)n4)cc3)n2)ccc1F	AlphaDrug	6G38	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10529	Cc1cc(Nc2nc(C(=O)NC3CCC(C)CC3)cc(-c3cc(F)cc(NC4CCC(O)C4)n3)n2)ccc1F	AlphaDrug	6G38	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10530	CCOc1ccc(-c2nnc(-c3ccc(C(=O)NCc4cccc(C(F)(F)F)c4)cc3)o2)cc1	AlphaDrug	4YKK	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

10516 to 10530 of 73725 items. Total 4915 pages.