Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
11401	Cc1cc(C(=O)NCc2cccc(-c3cccc(C(=O)O)c3)c2)ccc1NC(=O)C1CCCCC1	AlphaDrug	6I63	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11402	Cc1cc(-c2cc(F)c(F)c(Cc3cccc(Cc4ccccc4)c3)c2)ccc1NC(=O)C1CCCCC1	AlphaDrug	6I63	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11403	Cc1cc(-c2cccc(-c3ccc(-c4ccccc4)cc3)c2)c(Cl)c(NC(=O)c2ccc(N3CCCCC3)cc2)c1-c1cccc(C(=O)O)c1	AlphaDrug	6I63	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11404	Cc1cc(-c2cc(N3CCC(c4cc(C(=O)O)cc(C(F)(F)F)c4)CC3)ccc2C)ccc1NC(=O)C1CCCCC1	AlphaDrug	6I63	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11405	Cc1cc(C(=O)C2CCCCC2N)cc(C(=O)O)c1N	AlphaDrug	6I63	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11406	Cc1cc(-c2cccc(C(=O)O)c2)ccc1NC(=O)C1CCc2nc(-c3ccc(N4CCCC4)cc3)[nH]c21	AlphaDrug	6I63	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11407	CC(C)CC(NS(=O)(=O)c1ccc2ccn(Cc3ccc(C(F)(F)F)cc3)c2c1)C(=O)O	AlphaDrug	5NIH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11408	Cc1ccc(-c2ccc(S(=O)(=O)N3CCCCC3C(=O)NNC(=O)c3ccc4ccc(Cl)cc4c3)cc2)cc1	AlphaDrug	5NIH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11409	CC(C)CC(NS(=O)(=O)c1cccc(CN(CC2CCCC2)c2ccc(C(F)(F)F)cc2)c1)C(=O)O	AlphaDrug	5NIH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11410	CC(C)(C)c1ccc(-n2c(C(=O)O)nc3c(-c4ccc(C#N)cc4)cccc32)cc1	AlphaDrug	5NIH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11411	CC(C)CC(NS(=O)(=O)c1cccc(CNS(=O)(=O)c2ccc(Cl)c(N)c2)c1)C(=O)O	AlphaDrug	5NIH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11412	CC(C)CC(NS(=O)(=O)c1cccc(Cc2ccccc2)c1)C(=O)NC(Cc1ccccc1)C(=O)O	AlphaDrug	5NIH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11413	CC(C)CC(NS(=O)(=O)c1cccc(CNS(=O)(=O)c2ccc3ccccc3c2)c1)C(=O)O	AlphaDrug	5NIH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11414	CC(C)CC(NS(=O)(=O)c1ccc(-n2c(C(=O)O)nnc2-c2ccc(F)cc2)cc1)C(=O)O	AlphaDrug	5NIH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11415	CC(C)CC(NS(=O)(=O)c1cccc(-n2cnc(-c3ccc(F)cc3)n2)c1)C(=O)O	AlphaDrug	5NIH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

11401 to 11415 of 73725 items. Total 4915 pages.