Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
11551	Cc1cccc(S(=O)(=O)NC(=O)C2CCCC(NS(=O)(=O)c3ccc4ccccc4n3)CC2)c1	AlphaDrug	3AF2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11552	FC(F)(F)c1cc(CCCN2CCN(c3cccc(-c4ccc(N5CCOCC5)nc4)c3)CC2)cc(C(F)(F)F)c1	AlphaDrug	3AF2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11553	O=S(=O)(Nc1cccc(CCN2CCN(c3cccc(C(F)(F)F)c3)CC2)c1)c1ccccc1	AlphaDrug	3AF2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11554	Cc1cccc(S(=O)(=O)NC(=O)C2CCCC(NS(=O)(=O)c3cccc(-c4ncccn4)c3)CC2)c1	AlphaDrug	3AF2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11555	Cc1cccc(S(=O)(=O)NC(=O)C2CCCCC(C(=O)NC3CCCCC3C)CC2)c1	AlphaDrug	3AF2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11556	Cc1cccc(S(=O)(=O)NC(=O)C2CCCC(NS(=O)(=O)c3ccc4c(C)c(C)ccc4c3)CC2)c1	AlphaDrug	3AF2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11557	FC(F)(F)c1cccc(CCCN2CCN(c3cccc(-c4ccc(N5CCCNCC5)nc4)c3)CC2)c1	AlphaDrug	3AF2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11558	Cc1cccc(S(=O)(=O)NC(=O)C2CCCC(NS(=O)(=O)c3cccc(-n4cnnn4)c3)CC2)c1	AlphaDrug	3AF2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11559	Cc1cccc(S(=O)(=O)NC(=O)C2CCCC(NS(=O)(=O)c3cccc(-c4ccc(F)cc4)c3)CC2)c1	AlphaDrug	3AF2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11560	Cc1cccc(S(=O)(=O)NC(=O)C2CCCC(NS(=O)(=O)c3ccc4c(C)nccc4c3)CC2)c1	AlphaDrug	3AF2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11561	Cc1cccc(S(=O)(=O)NC(=O)c2cccc(-c3cccc(CN4CCCCC4)c3)c2)c1	AlphaDrug	3AF2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11562	Cc1cccc(S(=O)(=O)NC(=O)C2CCCCC3(CCC2)CCN(CC2CCCCC2)C3)c1	AlphaDrug	3AF2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11563	Cc1cccc(S(=O)(=O)NC2CCCC(NS(=O)(=O)c3cccc(-c4ccccc4)c3)CC2)c1	AlphaDrug	3AF2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11564	Cc1cccc(S(=O)(=O)NC(=O)C2CCCC(NS(=O)(=O)c3ccc4c(CC5CC5)cccc4n3)CC2)c1	AlphaDrug	3AF2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11565	Cc1cccc(S(=O)(=O)NC(=O)C2CCCC(NS(=O)(=O)c3cccc(C4CCCCC4)c3)CC2)c1	AlphaDrug	3AF2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

11551 to 11565 of 73725 items. Total 4915 pages.