Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
12091	COc1ccc(C2CCCCC2NS(=O)(=O)c2cccc(C3(c4ccc(OCCC5CC5)cc4)CCCC3)c2)cc1OC	AlphaDrug	3NFB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12092	COc1ccc(-c2cc(NC(N)(Cc3cccnc3)C3CCCCC3)c3[nH]ccc3n2)cc1OC	AlphaDrug	3NFB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12093	COc1ccc(C2CCCCC2NS(=O)(=O)c2cccc(C3(c4ccc(F)cc4)CCCC3)c2)cc1OC	AlphaDrug	3NFB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12094	COc1ccc(C2CCCCC2NS(=O)(=O)c2cccc(C3(c4ccc5[nH]cnc5c4)CCCC3)c2)cc1OC	AlphaDrug	3NFB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12095	COc1ccc(-c2cc(NC3CCN(CC(N)O)CC3)c3[nH]cc(-c4ccccc4)c3n2)cc1OC	AlphaDrug	3NFB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12096	COc1ccc(C2CCCCC2NS(=O)(=O)c2cccc(C3(c4ccc5c(c4)OCCO5)CCCC3)c2)cc1OC	AlphaDrug	3NFB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12097	COc1ccc(C2CCCCC2NS(=O)(=O)c2cccc(C3(c4ccc(F)c(Cl)c4)CCCC3)c2)cc1OC	AlphaDrug	3NFB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12098	COc1ccc(C2CCCCC2NS(=O)(=O)c2cccc(C3(C(=N)N)CCCC3)c2)cc1OC	AlphaDrug	3NFB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12099	COc1ccc(-c2cc(NC3CCN(CC(N)O)CC3)c3c(n2)C(=O)N=N3)cc1OC	AlphaDrug	3NFB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12100	COc1ccc(C2CCCCC2NS(=O)(=O)c2cccc(C3(c4c[nH]c5cc(F)ccc45)CCCC3)c2)cc1OC	AlphaDrug	3NFB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12101	COc1ccc(-c2c[nH]c3c(NC4CCN(CC(N)O)CC4)cc(-c4ccc(OC)c(OC)c4)nc23)cc1	AlphaDrug	3NFB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12102	COc1ccc(-c2cc(NC3CCN(CC(N)N)CC3)c3[nH]cc(CCCC(=N)O)c3n2)cc1OC	AlphaDrug	3NFB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12103	COc1ccc(-c2c[nH]c3c(NC4C=CN(CC(N)O)CC4)cc(-c4ccc(OC)c(OC)c4)nc23)cc1Cl	AlphaDrug	3NFB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12104	COc1ccc(-c2cc(NC3CCN(CC(N)O)CC3)c3[nH]cc(-c4ccc(O)c(C)c4)c3n2)cc1OC	AlphaDrug	3NFB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12105	COc1ccc(C2C=CCCC2NS(=O)(=O)c2cccc(C3(c4ccccn4)CCCC3)c2)cc1OC	AlphaDrug	3NFB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

12091 to 12105 of 73725 items. Total 4915 pages.