Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
12886	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(N3CCCCC3=O)cc2)cc1	AlphaDrug	3R58	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12887	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cccc(OC(C)C)c3)c2)cc1	AlphaDrug	3R58	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12888	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(N3CCN(c4ccc(C(=O)O)cc4)CC3)c2)cc1	AlphaDrug	3R58	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12889	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(Cl)cc2-c2ccc(N3CCN(C(=O)CCO)CC3)cc2)cc1	AlphaDrug	3R58	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12890	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(/N=C3\C(=O)CCC(NS(=O)(=O)c4ccccc4)NC3=O)cc2)cc1	AlphaDrug	3R58	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12891	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cccc(COc4cccc(Cl)c4)c3)c2)cc1	AlphaDrug	3R58	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12892	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(Cl)c(-c3cccc(C(=O)O)c3)c2)cc1	AlphaDrug	3R58	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12893	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(Cl)c(-c3ccncc3)c2)cc1	AlphaDrug	3R58	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12894	COc1ccc(S(=O)(=O)NC(=O)c2ccc(Cl)c(N3CCCCC3)c2)cc1	AlphaDrug	3R58	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12895	COc1cccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(N3CCCCC3=O)cc2)c1	AlphaDrug	3R58	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12896	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(Cl)cc2-c2ccc(C)c(NS(=O)(=O)c3ccccc3)c2)cc1	AlphaDrug	3R58	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12897	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cccc(NC(=O)Nc4ccccc4)c3)c2)cc1	AlphaDrug	3R58	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12898	COc1ccc(-c2ccc(C)c(NC(=O)c3ccc4ccccc4n3)c2C)cc1-c1ccccc1	AlphaDrug	3R58	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12899	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3ccc(N4CCN(C(C)(C)C)CC4)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	3R58	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
12900	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(Cl)c(-c3ccc(C)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	3R58	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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