Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
13561	CNCc1cc(-c2ccc3c(Nc4cc(C(=O)NC)ccc4OC)ncnc3c2)ccn1	AlphaDrug	5NWI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13562	COc1cc(-c2cc(OC(=O)c3ccc(F)cc3)ccc2C#CC(=O)NCC(C)(C)C)cc(OC)c1OC	AlphaDrug	5NWI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13563	COc1ccc(-c2ccc(Cl)c(Cl)c2)cc1Nc1ncnc2cc(F)ccc12	AlphaDrug	5NWI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13564	COc1ccc(-c2ccc(C(=O)Nc3cc(-c4cccc(-c5cccc(C)c5)c4)ccc3C(=O)NO)cc2)cc1	AlphaDrug	5NWI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13565	COc1ccc(-c2ccc(C(=O)NCc3cccc(-c4ccc(-c5ccc(CN)cc5)cc4)c3)cc2)cc1Nc1ncnc2cc(F)ccc12	AlphaDrug	5NWI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13566	COc1ccc(C(=O)Nc2cc(C(F)(F)F)ccc2C(F)(F)F)cc1NS(=O)(=O)C1CCCNC1=O	AlphaDrug	5NWI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13567	COc1ccc(-c2ccc(C(=O)NCc3cccc(-c4ccc(-c5ccc(C(N)=O)cc5)cc4)c3)cc2)cc1Nc1ncnc2cc(F)ccc12	AlphaDrug	5NWI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13568	CSc1ccccc1NC(=O)c1cc(Nc2ccc(N(C)C(=O)NC3CCC(C(=O)O)CC3)cc2)c2ccccc2n1	AlphaDrug	5CQT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13569	CSc1ccc(-c2cc(-c3ccc(-c4ccc(C(=O)O)cc4)cc3)n[nH]2)cc1	AlphaDrug	5CQT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13570	CSc1c(C(N)=O)cc(Nc2ccc(NC(C)C)c(F)c2)cc1C(F)(F)[PH](=O)(=O)Nc1ccc2ccccc2c1	AlphaDrug	5CQT	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13571	CSc1ccc(-c2cc(C(N)=O)cc3nc(Nc4ccc(N5CCOCC5)cc4)ncc23)cc1F	AlphaDrug	5CQT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13572	CSc1cccc(Nc2cc(-c3cccc(NC(C)=O)c3)ccn2)c1C(=O)NCC(F)(F)F	AlphaDrug	5CQT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13573	CSc1ccc(-n2c(C(=O)O)cc3nc(Nc4ccc(-c5c[nH]c(C(C)(C)C)n5)cc4)n(C)c32)cc1	AlphaDrug	5CQT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13574	C=C(COc1c(C(=O)Nc2ccc(Cl)c(Cl)c2)cc(C(=O)NCCCNS(C)(=O)=O)c2ccccc12)C(C)C	AlphaDrug	5CQT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13575	CSc1ccc(CC(C)(C)N(C)C(=O)O)c(-c2ccc(C(C)(C)C(=O)NC3CCC(C(=O)O)CC3)cc2)c1	AlphaDrug	5CQT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

13561 to 13575 of 73725 items. Total 4915 pages.