Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
15121	CC(C)c1cccc([SH](C)(=O)Nc2ccc(-c3cc(O)c4ccccc4c3)cc2)c1	AlphaDrug	4YHJ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15122	CC(C)c1cccc([SH](C)(=O)Nc2ccc(-c3cc(CN4CCCC4)c4ccccc4c3)cc2)c1	AlphaDrug	4YHJ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15123	CC(C)c1cccc([SH](C)(=O)Nc2ccc(-c3cccc(NC(=O)c4cccc(O)c4)c3)cc2)c1	AlphaDrug	4YHJ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15124	CC(C)c1cccc([SH](C)(=O)Nc2ccc(-c3cccc(C4CCN(C(=O)NCC(C)(C)C)CC4)c3)cc2)c1	AlphaDrug	4YHJ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15125	CC(C)c1cccc([SH](C)(=O)Nc2ccc(-c3cccc(NC(=O)c4ccc(C(F)F)nc4)c3)cc2)c1	AlphaDrug	4YHJ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15126	CC(C)c1cccc(C(C)(C)C(=O)Nc2ccc(-c3ccc4c(c3)nnn4Cc3ccc(N)cc3)cc2)c1	AlphaDrug	4YHJ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15127	Cc1cccc(C(=O)Nc2cccc(-c3n[nH]c4ccc(C#Cc5ccccc5)cc34)c2)c1	AlphaDrug	4YHJ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15128	CC(C)c1cccc([SH](C)(=O)Nc2ccc(-c3cccc(C4=CCCC(C(=O)O)CC4)c3)cc2)c1	AlphaDrug	4YHJ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15129	CC(C)c1cccc([SH](C)(=O)Nc2ccc(-c3cccc(NC(=O)Nc4ccc(C(F)(F)F)nc4)c3)cc2)c1	AlphaDrug	4YHJ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15130	CC(C)c1cccc([SH](C)(=O)N2C/C3=C/C=C(/NC(=O)C(C)(C)CCN(CC4CCCC4)C2=O)c2ccccc2C(F)O3)c1	AlphaDrug	4YHJ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15131	CC(C)c1cccc(C(C)(C)C(=O)Nc2ccc(-c3ccc4c(CN5CCNCC5)cccc4c3)cc2)c1	AlphaDrug	4YHJ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15132	CC(C)c1cccc([SH](C)(=O)Nc2ccc(-c3cccc(NC(=O)c4ccc(N5CCOCC5)cc4)c3)cc2)c1	AlphaDrug	4YHJ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15133	CC(C)c1cccc([SH](C)(=O)Nc2ccc(-c3cccc(NC(=O)c4ccc(S(C)(=O)=O)cc4)c3)cc2)c1	AlphaDrug	4YHJ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15134	CC(C)(C)c1cccc(C(=O)Nc2cccc(-c3c[nH]c4ccc(F)cc34)c2)c1	AlphaDrug	4YHJ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15135	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cccc(-c3c[nH]c4cc(C(N)=O)ccc34)c2)c1	AlphaDrug	4YHJ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

15121 to 15135 of 73725 items. Total 4915 pages.