Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
15211	Cn1ccnc1C(Cc1ccc(N2CCOCC2)nc1)c1nc(-c2cccc(Cl)c2)cs1	AlphaDrug	3WTO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15212	Cn1cnc(-c2ccc(Cl)cc2)c1C(=O)NCc1ccc(S(N)(=O)=O)cc1	AlphaDrug	3WTO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15213	CC(CNc1ccc(Cl)cc1)NC(=O)c1ccc(-c2ccc(Cl)cc2)cc1Cl	AlphaDrug	3WTO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15214	Cn1ccnc1C(Oc1ccc(-c2nc(=O)[nH]c3ccc(Cl)cc23)cc1)c1ccc(Cl)cc1	AlphaDrug	3WTO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15215	CC(Cc1ccc(N2CCC(O)(Cc3ccc(C(F)(F)F)cc3)CC2)nc1)Nc1cc2nc(-c3ccccc3)[nH]c2cc1F	AlphaDrug	4R4O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15216	CC(Cc1ccc(N2CCC(O)(Cc3cccc(-c4cccc(OC(F)(F)F)c4)c3)CC2)nc1)Nc1nc2ccccc2[nH]1	AlphaDrug	4R4O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15217	CC1CC(c2ccc3nc(-c4ccccc4)[nH]c3c2)NC(=O)c2ccccc2O1	AlphaDrug	4R4O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15218	CC(Cc1ccc(N2CCC(O)(Cc3cccc(-c4ccccn4)c3)CC2)nc1)Nc1nc2ccccc2[nH]1	AlphaDrug	4R4O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15219	CC(Cc1ccc(N2CCC(O)(Cc3cccc(-c4ccc(C(C)(C)C)cc4)c3)CC2)nc1)Nc1nc2ccccc2[nH]1	AlphaDrug	4R4O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15220	CC(Cc1ccc(N2CCC(O)(Cc3cccc(-c4ccc(C(F)(F)F)cc4)c3)CC2)nc1)C(=O)NC1CCCC1O	AlphaDrug	4R4O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15221	CC(Cc1ccc(N2CCC(O)(Cc3cccc(-c4ccc(C(F)(F)F)cc4)c3)CC2)nc1)Nc1nc2ccccc2[nH]1	AlphaDrug	4R4O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15222	CC(Cc1ccc(N2CCC(O)(CO)C2)nc1)c1cc(F)c(-c2ccc(C(=O)NC3CCC(C(=O)NCC(=O)O)CC3)cc2)cc1F	AlphaDrug	4R4O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15223	CC(Cc1ccc(N2CCC(O)(Cc3cccc(-c4ccccc4)c3)C2)nc1)c1ccccc1	AlphaDrug	4R4O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15224	CC(Cc1ccc(N2CCC(O)(Cc3cccc(C(F)(F)F)c3)CC2)nc1)Nc1cc2nc(-c3ccccc3)[nH]c2cc1F	AlphaDrug	4R4O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15225	COc1ccc2[nH]c(C(=O)NCCCCNC(=O)C3CCCCC3)cc2c1	AlphaDrug	5VIH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

15211 to 15225 of 73725 items. Total 4915 pages.