Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
15601	CCC(=O)N1CCCC(Nc2cc(-c3cc4c(CCc5ccc(C(=O)/N=C/CN(C)C)cc5)ncnc4c(=O)n3C)ccc2C)CC1	AlphaDrug	5N34	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15602	CCC(=O)N1CCC(Nc2cc(-c3ccc(F)cc3)cc(NC(=O)Nc3ccc(C)nc3)n2)CC1	AlphaDrug	5N34	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15603	CCC(=O)N1C=CC(Nc2cc(-c3ccc(F)cc3)cc(NCc3ncc(F)c(N)n3)c2OC)CC1	AlphaDrug	5N34	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15604	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccc(-c2ccccc2)cc1)NC(=O)CN(C)Cc1cccc(OCC(=O)O)c1)C(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)C(N)=O	AlphaDrug	4JYT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15605	CC(C)CNC(=O)C(Cc1ccc(OCC(=O)O)cc1)NC(=O)C1CCCCN1C(=O)c1ccc(C2CC2)cc1	AlphaDrug	4JYT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15606	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccc(C(=O)O)cc1)NC(=O)C1CCCCN1C(=O)c1cccc(OCC(=O)O)c1)C(=O)NCc1ccccc1	AlphaDrug	4JYT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15607	Cc1ccc(-c2ccc(CC(C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NCc3ccc(-c4ccccc4C(=O)NCC(=O)O)cc3)C(=O)OC(C)(C)C)cc2)cc1	AlphaDrug	4JYT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15608	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccc(C(=O)O)cc1)NC(=O)C1CCCCC1N)C(=O)NC1CCCCN(C(=O)c2ccc(O)cc2)CC1=O	AlphaDrug	4JYT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15609	CC(=O)c1cnc(-c2cc(C3(C(=O)NCc4ccccc4)CC3)ccc2C(=O)NCCCCCC(=O)O)o1	AlphaDrug	4JYT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15610	Cc1cc(C2CC2)ccc1C(=O)N1CCCC1C(=O)NC(Cc1ccc(O)c(I)c1)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NCc1ccccc1	AlphaDrug	4JYT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15611	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)c1cccc(OCC(=O)O)c1)C(=O)C(C)NCc1ccccc1	AlphaDrug	4JYT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15612	Cc1ccc(-c2ccc(CC(NC(=O)C3CNC(=O)c4ccccc43)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NCC(=O)NC3CCC/C=C\N(C(=O)CN(C)Cc4ccccc4)C3)cc2)cc1	AlphaDrug	4JYT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15613	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)c1ccccc1)C(=O)NC1CC=CCC1C(=O)NC(=O)NC1(C#N)CCCCC1	AlphaDrug	4JYT	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15614	Cc1cccc(-c2cc(Cc3cnccc3-c3ccccc3)cc3ccccc23)c1	AlphaDrug	5DQE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15615	Cc1cccc(-c2cc(Cc3ccccc3C(=O)O)cc3ccccc23)c1	AlphaDrug	5DQE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

15601 to 15615 of 73725 items. Total 4915 pages.