Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
15721	CC(C)(C)c1cn(-c2ccc(NS(C)(=O)=O)cc2)c2ccc(OC3C=CC(=O)N3)cc12	AlphaDrug	4NL1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15722	Cc1ccc(NC(=O)c2c[nH]nc2-n2cc(C(C)(C)C)c3nc(NS(C)(=O)=O)cnc32)cc1NCCO	AlphaDrug	4NL1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15723	CC(C)(C)c1cn(-c2cc(SCCc3cc(NS(C)(=O)=O)ccc3O)c(C(F)(F)F)cn2)c2ncc(NCc3ccccc3)nc12	AlphaDrug	4NL1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15724	Cn1cc(CCn2cc(C(C)(C)C)c3cc(-c4ccccc4OCCO)ccc32)c2cc(-c3cccnc3)ccc21	AlphaDrug	4NL1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15725	CC(C)(C)c1cn(-c2ccc(NS(C)(=O)=O)cc2)c2ccc(C(=O)NO)cc12	AlphaDrug	4NL1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15726	CC(C)(C)c1cn(-c2cc(SCc3ccc(OC(F)(F)F)cc3)c(N)n3ncnc23)c2ccc(OC(F)(F)F)cc12	AlphaDrug	4NL1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15727	CC(C)(C)c1cn(-c2ccc(NS(C)(=O)=O)cc2)c2ccc(C(=O)NO)cc12	AlphaDrug	4NL1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15728	CC1(C)CCCC(Nc2cc(Cl)c(NC(=O)Nc3ccc(Cl)c(S(N)(=O)=O)c3)c(Cl)c2)CC1	AlphaDrug	5IVV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15729	Nc1nc(NC2CCCCC2)sc1C(=O)Nc1ccc(S(=O)(=O)NC2CC2)cc1	AlphaDrug	5IVV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15730	CC1CCCC(NC(=O)c2cc(C(=O)Nc3ccc(S(C)(=O)=O)cn3)cc(C(F)(F)F)c2)CC1	AlphaDrug	5IVV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15731	CC1CCCC(NC(=O)c2cc(C(=O)Nc3ccc(O)cc3)cc(C(F)(F)F)c2)CC1	AlphaDrug	5IVV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15732	Cc1ccc(C(=O)Nc2cccc(C(F)(F)F)c2)cc1C(=O)N1CCN(S(=O)(=O)c2ccccc2)CCC1C	AlphaDrug	5IVV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15733	CC1CCCC(Nc2cc(C(=O)Nc3nc(-c4c(F)cccc4Cl)cs3)ccc2O)CC1	AlphaDrug	5IVV	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15734	CC1CCC(CCCCC(=O)NCCCCC(=O)O)N1S(=O)(=O)c1ccc(N2CCN(C(=O)NCCO)CC2)cc1	AlphaDrug	5IVV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15735	CC1CCCC(NC(=O)c2cc(C(=O)Nc3cccc(N)n3)cc(C(F)(F)F)c2)CC1	AlphaDrug	5IVV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

15721 to 15735 of 73725 items. Total 4915 pages.