Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
18811	CCC(C)C(NC(=O)c1ccc(OC)cc1)C(=O)NC(Cc1ccccc1)C(=O)NC1CCC(C(=O)NC(C)C2CCCCCC2)C1	AlphaDrug	4Y3Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18812	CCC(C)C(NC(=O)c1ccc(OC)cc1)C(=O)NC(Cc1ccc(Cl)cc1)C(=O)OC(C)(C)C	AlphaDrug	4Y3Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18813	CCC(C)C(NC(=O)c1ccc(OC)cc1)C(=O)NC(Cc1ccccc1)C(=O)NC1CCC(C(=O)NC2(C(=O)O)CC2)C1	AlphaDrug	4Y3Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18814	CCC(C)C(NC(=O)c1ccc(OC)cc1)C(=O)NC(Cc1ccccc1)C(=O)NC1CN(CCO)CC1O	AlphaDrug	4Y3Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18815	CC(C)(C)N1CCN(c2cc(-c3cc(C(=O)O)ccc3C(F)(F)F)ccn2)CC1	AlphaDrug	4ZBI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18816	CC(C)(C)N1CCN(c2cc(-c3nc(Nc4cccc(C(F)(F)F)c4)nc4ncccc34)ccn2)CC1	AlphaDrug	4ZBI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18817	CCc1cc(NC(=O)Nc2ccc(-c3nc(Nc4ccc(C(=O)O)cc4)ncc3Cl)cc2)cnc1N	AlphaDrug	4ZBI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18818	CC(C)(C)N1CCN(c2cc(-c3nc(Nc4ccc(C(F)(F)F)cc4)cc4ncncc34)ccn2)CC1	AlphaDrug	4ZBI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18819	CC(C)(C)N1C=CN(c2cc(-c3nc(Nc4ccc(C(F)(F)F)cc4)cc4[nH]ccc34)ccn2)CC1	AlphaDrug	4ZBI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18820	CC(C)(C)N1CCN(c2cc(-c3nc(Nc4cccc(NS(C)(=O)=O)c4)nc4ccccc34)ccn2)CC1	AlphaDrug	4ZBI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18821	CC(C)(C)c1cc(NC(=O)Nc2cccc3ccccc23)nc(N2CC=C(c3ccc4ccccc4c3)CC2)n1	AlphaDrug	4ZBI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18822	CC(C)(C)N1CCN(c2cc(-c3nc4cc(C(=O)NC5CCCC(C(=O)O)CC5)ccc4o3)ccn2)CC1	AlphaDrug	4ZBI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18823	CC(C)(C)N1CCN(c2cc(-c3nc(C4CC4)cc(N)c3C(=O)NCc3cnc[nH]3)ccn2)CC1	AlphaDrug	4ZBI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18824	CC(C)(C)N1CCN(c2cc(-c3nc(Nc4cccc(C(F)(F)F)c4)cc4ccncc34)ccn2)CC1	AlphaDrug	4ZBI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18825	CNC(=O)c1ccc(CSc2cc(NC(=O)c3ccc(-c4ccccc4)cc3)sn2)cc1	AlphaDrug	4PQA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

18811 to 18825 of 73725 items. Total 4915 pages.