Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
18781	Cc1ccc(-c2[nH]c(C3CCC3)nc2-c2cccc(NC(=O)c3nc4ccccc4[nH]3)c2)cc1	AlphaDrug	4URZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18782	Cc1ccc(-c2[nH]c(C(N)=O)nc2-c2ccccc2)cc1	AlphaDrug	4URZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18783	Cc1ccc(-c2[nH]c(-c3ccc(CNC(=O)c4ccc(N5CCOCC5)cc4)cc3)nc2-c2ccccc2)cc1	AlphaDrug	4URZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18784	Cn1nc(Cc2ccc(-c3cccc4[nH]c(-c5cccc(NC(=O)NCc6cccnc6)c5)cc34)cc2)c2ccccc21	AlphaDrug	4URZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18785	Cc1ccc(-c2sc(C(F)(F)F)nc2CNC(=O)c2ccc(/N=C/c3ccncc3)cc2)cc1	AlphaDrug	4URZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18786	Cc1ccc(-c2[nH]c(-c3ccccc3C(F)(F)F)nc2-c2ccc(NC(=O)NCCC(F)(F)F)c(C#N)c2)cc1	AlphaDrug	4URZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18787	Cc1ccc(-c2[nH]c(C3CCNCC3)nc2-c2cccc(NC(=O)c3cccnc3)c2)cc1	AlphaDrug	4URZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18788	CCc1ccc(S(=O)(=O)NC(=O)OC2CCN(c3ccc(C(=O)N4CCCC4)cn3)CC2)cc1	AlphaDrug	4U6Z	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18789	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3ccc(-c4ccccc4)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	4U6Z	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18790	O=C(NCCO)c1cc(-c2ccc(C#CC3CCCCC3)c(Cl)c2)n[nH]1	AlphaDrug	4U6Z	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18791	CCc1c(C(=O)NCCCC(O)CN2CCOCC2)nn2c(C(=O)O)cnc(N)c12	AlphaDrug	4U6Z	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18792	CCc1ccc(S(=O)(=O)NC(=O)OC2CN(c3cc(C(=O)c4ccccc4)ccn3)C2)cc1	AlphaDrug	4U6Z	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18793	CCc1ccc(S(=O)(=O)NC(=O)OC2CCN(c3nc4scc(-c5ccccc5)c4s3)C2)cc1	AlphaDrug	4U6Z	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18794	CCc1ccc(S(=O)(=O)NC(=O)OCc2ccc(N3CCN(C)CC3)cc2)cc1	AlphaDrug	4U6Z	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18795	CCc1ccc(S(=O)(=O)N2CCC(NC(=O)c3ccc(N4CCOCC4)cc3)CC2)cc1	AlphaDrug	4U6Z	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

18781 to 18795 of 73725 items. Total 4915 pages.