Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
20521	NS(=O)(=O)c1ccc(OCC2CCN(S(=O)(=O)c3ccc(N(Cc4ccc(-c5ccccc5)cc4)C(F)(F)F)cc3)CC2)cc1	AlphaDrug	6JDI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20522	NS(=O)(=O)c1ccc(Nc2nc(-c3ccccc3)no2)cc1	AlphaDrug	6JDI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20523	CC(C)CC(NS(=O)(=O)c1ccc(-c2ccc(C(=O)N3CCOCC3)cc2)cc1)c1ccc(-c2cncnc2)cc1	AlphaDrug	4N6G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20524	COc1ccc(-c2ccc(-c3cnc(NC(=O)c4ccc(C(F)(F)F)cc4)nc3)cc2)cc1	AlphaDrug	4N6G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20525	CC(C)CC(NS(=O)(=O)c1ccc(-c2cccc(C(F)(F)F)c2)cn1)c1cccc(NC(=O)c2ccccc2)c1	AlphaDrug	4N6G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20526	CC(C)CC(NS(=O)(=O)c1ccc(-c2cccc(F)c2)cc1)c1cccc(NC(=O)c2ccccc2)c1	AlphaDrug	4N6G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20527	CC(C)CC(NS(=O)(=O)c1ccc(-c2ccc(C(=O)N3CCC(N4CCCC4C(=O)N4CCOCC4)CC3)cc2)cc1)c1cccnc1	AlphaDrug	4N6G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20528	CC(C)c1ccc(-c2ccc(-c3cnc4ccccc4c3)cc2)cc1	AlphaDrug	4N6G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20529	CC(C)CC(NS(=O)(=O)c1ccc(-c2ccc(C(=O)N3CCC(N4CCOCC4)CC3)cc2)cc1)c1ccccc1	AlphaDrug	4N6G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20530	CC(C)CC(NS(=O)(=O)c1ccc(-c2ccc(C(=O)N3CCC(N4CCOCC4)CC3)cc2)cc1)c1ccnc(C(F)F)c1	AlphaDrug	4N6G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20531	CC(C)CC(NS(=O)(=O)c1ccc(-c2cccc(C(=O)N3CCN(c4ccccc4)CC3)c2)cc1)c1ccccc1	AlphaDrug	4N6G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20532	CC(C)CC(NS(=O)(=O)c1ccc(-c2ccc(-c3cnoc3)cc2)cc1)c1cccc(C(=O)NCCC(F)(F)F)c1	AlphaDrug	4N6G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20533	O=C(O)c1ccc2c(c1)[nH]c1c(-c3ccccc3)cc(-c3cccc(NC4CC4)c3)cc12	AlphaDrug	6BM5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20534	O=C1Cc2cc(-c3ccc(O)cc3)ccc2N1	AlphaDrug	6BM5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20535	Oc1cccc(-c2[nH]c3cc(O)c(O)cc3c2O)c1	AlphaDrug	6BM5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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