Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
63781	NC(=O)n1cc2c3c1NCN=C3NCCNC2	SBDD	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63782	CNCC1=C2C=NC=C3N=CN(C1)N32	SBDD	4IIY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63783	Cc1nc2ccccc2n1C#CNC(C)(CO)CO	SBDD	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63784	O=C(O)C(O)C(O)C(O)C(=O)CO	SBDD	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63785	CNCc1cn(C(C)=O)c2ncnc(N)c12	SBDD	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63786	N[C@H]1Nc2cccc3c2N1[C@H]1O[C@@]1([C@H](O)C=NC(=O)[C@H](O)[C@@H](O)CO)N3	SBDD	4IIY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63787	CC(O)C(O)C(O)C1NCc2nc3ccccc3n2C1=O	SBDD	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63788	OC/C1=C\C(O)C(O)C2CCC(O)CC(CCCC3=COC4=C(O3)N1CC4)CC2O	TargetDiff	4YTC	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63789	O=C1/N=C2/C=NNC(=C2)C(O)C2=CC/C(=C(\O)C3NC(O)CC(O3)C3CCC1C3)C=C2	TargetDiff	4YTC	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63790	Cc1cc2c3c(c1)C1CCCN1CCCc1ncc(c-3n1)NC2	TargetDiff	4YTC	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63791	CC1CC2CC(Oc3ccccc3)CC(=O)N2C1c1nc2c(cc1N)NNN2	TargetDiff	4YTC	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63792	CC=C(C)N1C2=C(CCC=C2)N=C2NNC(=O)[C@H]21	TargetDiff	4YTC	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63793	OCC1C(O)C(O)C2=C/C(=N\C3=NC=CC(C=C3)CC=C=C3CN4CCCC14NC3F)CS2	TargetDiff	4YTC	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63794	CCOC1=CC2=NN=C[C@H]3C2=C(C2=C3C(=O)NCN2C(C)=NC(C)C)[C@@H]1CO	TargetDiff	4YTC	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63795	CCC(=NN=C1NCC2CC3CCCC3=C12)NC(C)=O	TargetDiff	4YTC	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

63781 to 63795 of 73725 items. Total 4915 pages.