Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
63796	CCN1C=C(O)Cc2cc3c(cc21)C1OC(CNC2=COCCC2/C=C\CN3)C(O)P1(=O)O	TargetDiff	4CD5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63797	CC1CCC2(O)CCOc3ccccc3C3OC(c4ccccc4)OC(C(=O)O)(C(O)C(C)NO)OC3C2O1	TargetDiff	4CD5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63798	CC1C(O)C(O)CC2C3C(O)CC(C(=O)O)C3CCC(C(O)(CO)CO)C2C2CC1C(C)(C)O2	TargetDiff	4CD5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63799	C[C@@H](O)C(O)(O)[C@@H](O)NC(=O)[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)CN2C(=O)c3ncnc(=CO)c3=C12	TargetDiff	4CD5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63800	N=C1CC(C2CC3OC(CO)(N2)C(O)C(O)(O)COC3CCO)=CCN1	TargetDiff	4CD5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63801	COCC(O)C(O)C(COCC1(O)OCCC1O)NC(=O)CC1=NN=C2CC=CC=C2N1C	TargetDiff	4CD5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63802	CCOC(C)C(COC1COCCC2=C(CCCC(C)=O)CCN2CC(C)C(O)(CO)C1O)C(O)C1OC(C)C(O)CC1C	TargetDiff	4CD5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63803	CC(CCO)OC1C(O)NC(O)CC(CO)C1C(O)C(=O)N1CCC(C(O)C(O)CO)C2C=CCC=C21	TargetDiff	4CD5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63804	CC1C=CC2=C/OC(P(=O)(O)O)C(CC3C(=O)NC(O)C3O)OC(C(O)C3CCO3)CC\N=C\2C1=N	TargetDiff	4CD5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63805	CCC(C(=O)O)C1NC(=O)c2c3c(cc4c2C(O1)C(O)C4C(O)C1CCCCN1)Cc1ncccc1-3	TargetDiff	4CD5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63806	C/C1=N/N=C\C2OC(O)(C(O)C3C=CNN=C3)CC(O)C2C(=O)N1.[O]P([O])OP(=O)(O)OO	TargetDiff	6CVF	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63807	N=C1NCC2=C1NCC1N2CC(C(O)COP(=O)(O)O)C1(O)O	TargetDiff	6CVF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63808	NC(=O)C1CNCN(C(COP(=O)(O)O[P](=O)P(=O)(O)O)OC(O)C(O)CO)CN1	TargetDiff	6CVF	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63809	N=C1NCC(C(N)C(O)CC(CO)O[P](=O)OP(=O)(O)[P](=O)O)C1=N	TargetDiff	6CVF	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63810	N=C1N=NC2=C1C=NCN2C(=O)C(CO)C(O)CO.O=P(O)(O)O	TargetDiff	6CVF	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

63796 to 63810 of 73725 items. Total 4915 pages.