Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
63811	CCN1C(=O)COC2CC3C(=C21)CC(NC(N)=O)C(c1ccccc1)=CC3OCC(C)C	TargetDiff	6CVF	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63812	N=C1N=C[C@@H](O)C(CN2NC[C@@H](O)CNC2=N[P@@](=O)(O)OP(=O)(O)O)=N1	TargetDiff	6CVF	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63813	CCCCCCC(C)C1=NC(=N)N=CC1NC(C)C.O=P(O)(O)O	TargetDiff	6CVF	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63814	COP(=O)(O)OC1(O)OCC(CC(=O)O)OC1CCC1N=CC(=O)NC1=O	TargetDiff	6CVF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63815	CCC(O)C(C1CCO1)C(C)C(OC1CCC(O)C(O)C1C1=NC(=O)NC(=N)C1)C(=O)O.O=P(O)(O)C(O)C(O)CO	TargetDiff	6CVF	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63816	O=C(O)NCCC1OC(C(=O)O)OC1=O	TargetDiff	6OF5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63817	O=C(O)C(O)C1CC(CCO)C(O)C1O	TargetDiff	6OF5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63818	O=CC1=CC=CN2C(=O)C(C3NC(P(=O)(O)O)CO3)NC(C(O)C(O)CC3C=CCC=C3O)=C12	TargetDiff	6OF5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63819	CCNCCCC(O)(O)C1C(C)CCC1C(O)C1OC(OC)C2C(O)CC(C(=O)O)OC2C1CO	TargetDiff	6OF5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63820	CC1CCC(O)(O)CC(O)C1C(=O)O.O=C(O)C1CC(O)C(C(O)CO)C1O	TargetDiff	6OF5	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63821	C[C@](O)(CCCC(O)(O)O)CC[C@H](O)[C@H](O)CC(O)=C(O)[C@@H](O)[C@]1(O)CCOC1	TargetDiff	6OF5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63822	CC(CCC(=O)O)CC1CC(O)C(=O)O1	TargetDiff	6OF5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63823	CC(C(CO)Oc1ccnc2c1C(=O)N(CC1CC(C(=O)O)C1)CC2)C(O)C(=O)O	TargetDiff	6OF5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63824	O=C(O)O.O=C(O)c1cnccc1C1CCCCCNC1	TargetDiff	6OF5	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63825	CC(NC(=O)CC1COC2C(NCN2O)C(=O)N1C)C(=O)O	TargetDiff	6OF5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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