Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
63826	CC1CCC(C)C1O.CCC1CCC23CC(C(=O)O2)C2=CCC(=O)C/C2=N/c2cc(ccc2Cl)C3OC1C1=CCC(=O)N=C1	TargetDiff	6HAI	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63827	C=C(C(CC1CC(C2=C(O)CN(CO)C2)CC1C)c1ccc2c3c(cccc13)OC2(O)O)N(CC(C)=S)OC(C)C	TargetDiff	6HAI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63828	CC(=O)CCCC1CCCCCC1C1CC2CCC(N2)OC2=CN(CC=C2O)C(=O)NCC2=CC(=C(F)C=CN2)C1=O	TargetDiff	6HAI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63829	CON1C(=O)C2C=CC=C3c4cc(C=CCC=CCl)ncc4[C@H](C4=CCC(F)=C[C@@H]41)N32	TargetDiff	6HAI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63830	C=CNCC(C)(O)c1ccc(C(CCC(=O)OCO)c2cccc(F)c2)cc1	TargetDiff	6HAI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63831	CCCO[C@@H]1N[C@H](C)C2C[C@H]3CC/C=C\[C@@H](CC3)[C@]23[C@@H](CC2=C[C@H](Cl)C=CC2=CC[C@@H](CN)C(=O)O)CC(C(=CO)O1)[C@H]3O	TargetDiff	6HAI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63832	COC1=CC=CC2(O)C1C1=CCCC3=C1C1N(O3)C3=C(OC)C(=O)C4=C(F)CC(=C43)C12O	TargetDiff	6HAI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63833	COC(=O)C1CN([C@H]2[C@@H](O[C@@H](C=CCC=CCl)NC(C)=O)[C@H]3CC(C(F)F)=C(F)[C@H]3[C@@H]3C=CC(=O)C(=O)N32)C2=C1CCC2	TargetDiff	6HAI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63834	CCCCCc1cccnc1C1/C=C(/C)NCC2=CC=CC/C2=N\C(=O)c2cccc(c2)N1	TargetDiff	6HAI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63835	Cc1ccc(N2N[C@H](C[C@H](C)CC=NC[C@@H](C)O)C3=C2CC(C(=O)S)S3)cc1	TargetDiff	6HAI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63836	O=C(O)C1CCC(n2cnc(=O)c3cc(Cl)c(O)cc32)CC1	TargetDiff	4OAG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63837	CCC1OC(OP(=O)(O)O)CCC1C1=C=C2C(NCC(=O)OC)CCC2C(=O)NC(=O)C(C)CO1	TargetDiff	4OAG	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63838	CC(=O)C1=NCC(CC2NC(CC3CC(O)C3(O)O)C(C)(O)C(CO)C(=O)O2)N1	TargetDiff	4OAG	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63839	CC1=CC=Nc2c3c(ccc2=N1)=C(O)C=C(P(=O)(O)O)C3C.O=[P](O)O	TargetDiff	4OAG	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63840	CC1C=C(COP(=O)(O)OC2OC(N3C=Nc4nnnnc4N3)CC2=O)CC=N1.[O]P([O])OP(=O)(O)O	TargetDiff	4OAG	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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