Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
63901	OC1=C(C2=CCC3C(O)CCCC3CC2)C=CN=C(F)C1	TargetDiff	4WRB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63902	COC1C(C)=CCC=C1C(=O)C1OC2C3C(=C(C)C(C(=N)C4=NC(N)N4)=CC13)CCC2(O)C1CCC(CCO)O1	TargetDiff	5ZA8	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63903	CC1(O)CCC2=C(CC=C(C=N)C2=N)C1O.CCC(O)OC	TargetDiff	5ZA8	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63904	CNC1C(O)CC2C3=CC(C4=CCC5=C6CNC(=N)N6NC5=C4)=CCC3CN2CCCCC(O)C(N)(O)C1C.NC(=O)C(=O)O	TargetDiff	5ZA8	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
63905	CC(=O)C1=Nc2c(nnc3cc4c(cc23)C2=NC(=N)N=C2C4)N=CC1	TargetDiff	5ZA8	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63906	CC(CCCOC(=O)C(=O)OCC1=C2C=CC(C(=N)N)C=C2CC1)N(C)C(=O)O	TargetDiff	5ZA8	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63907	CC(=O)OC(C)C1=Cc2c(ncc3c2CC(C(=N)NN)C3)OC(CC(=O)O)C1O	TargetDiff	5ZA8	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63908	COc1cccc(N2CS/C3=N/C/C=C4/C(=N)C(=N)NC4=C=C32)c1	TargetDiff	5ZA8	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63909	OC1(O)CC(C2C=CC(F)C=C2)=CN2c3c(ccc4c3CC3=C5NCN=C5NC34)CC21	TargetDiff	5ZA8	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63910	CCC(=O)N1C2=CC=CC(C3=NCC(=N)N3)C2=C2CC(N(C)O)CN21	TargetDiff	5ZA8	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63911	OC1C(O)C2OC3C(OCC(O)C3(O)O)C(O)C2C1O	TargetDiff	6ST0	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
63912	O=C(O)CCC(C(=O)O)C(O)C(O)C(O)C(O)(O)C(O)C(=O)CC(=O)O	TargetDiff	6ST0	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
63913	CC(=N)NC(=O)CC1C(C(CO)C(F)P(=O)(O)O)CCN1CO	TargetDiff	6ST0	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
63914	NC(=O)CC(N)C(O)C(O)CC[P](=O)OC(=O)O.NCCO	TargetDiff	6ST0	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
63915	C1CCCNCC1.CC(O)C(N)C(O)C1=CC=C(O)CC1O.CCCC(=O)C1CCC(C(=O)O)N1	TargetDiff	6ST0	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔

63901 to 63915 of 73725 items. Total 4915 pages.