Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
63961	OS1(O)NCC2=CC=CC(C=C2)NC2C=CC3=C4C2OCCCCCN4C(C3)C2C=CCC1C=C2	TargetDiff	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63962	CCC(C)(C=O)C1NC(CC2=CCCC=C2)=NC1(C)O	TargetDiff	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63963	CC1NC(S(O)(O)NC(C)(C)C)CC(C2CCc3ccccc32)C1C	TargetDiff	3B6H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63964	CC(=O)C1CC=NC2=NN(CN)C3=C4C/C(=N\C5=C(C=C=CCC=C=CC1=C24)CC(=O)N5)N3	TargetDiff	5UT6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63965	CC1=C2CCCC3(C)C(=C=C2NC(=N)N=C1)C(O)C(C)C3O	TargetDiff	5UT6	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63966	O=C1NOC2C=CC(=NCCO)CC=C12	TargetDiff	5UT6	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63967	O=C(O)C1C2=C=C(/N=C\C3C(=CC=C(CO)C3O)N2)C2=C(NCN2)c2ccccc21	TargetDiff	5UT6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63968	OC1CCC2=C(CNC1O)C1=C(NNC1)C1=CCC=CN12	TargetDiff	5UT6	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63969	CC1=C(C)N2OCC(O)C(O)=C3Cc4c(ccnc4C)C=C1C32	TargetDiff	5UT6	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63970	N=C1C=C2CN(O)C(C3CCC(O)C3)/C(O)=[C]/C(=O)NC3=C2C(=NN1)CN3	TargetDiff	5UT6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63971	C1CNNN1.CCC(C)N(CN)CC(N)=O.O=C(O)O.c1ccc(C2CCNN2)cc1	TargetDiff	5CT2	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
63972	CCCC1NC(C(=O)O)N1CC1CC2CC(O)CC2C1	TargetDiff	5CT2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63973	COCONC1=NC2CCC3CCCC=CC3CC(CC(=O)O)(C1)C2	TargetDiff	5CT2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
63974	CC1(O)CCNC2=C1CCCCN2.O=C(O)C1OC(C2CCOC2)OC1CCO	TargetDiff	5CT2	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
63975	CC=CC(N)=O.CC=O.[CH]=NCNCCC=C(O)[C@@H](CC=O)OCCC[C@@H](O)CCO	TargetDiff	5CT2	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔

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