Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
64006	N=C1C(=O)C2C(=C(F)C3CSC(C4=CC(C(=O)O)C=CC=C4)OC3C2O)OS1(O)O	TargetDiff	6FAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64007	CC1c2cc(-c3cccc(N(C)O)c3)ccc2N2C(=O)C(O)(C(=O)O)C3=C2C1C=CC(F)=C3	TargetDiff	6FAF	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64008	CCCC1CC2C=C=C(CNC(F)C(CC(CC)C(N)(N)O)C(=O)O2)NC(=O)CCN1	TargetDiff	6FAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64009	CC(O)C1=CC(C(=O)O)C(C=N)C(S(=O)O)C=C1	TargetDiff	6FAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64010	[O]S1([O])Nc2cc(F)c(C(=O)O)cc2C2=C1CC(C(=O)O)S2	TargetDiff	6FAF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64011	C[C@@H](c1ccccc1)[C@H](C(F)F)[C@H](CS[S@](N)=O)C(=CO)CO	TargetDiff	6FAF	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64012	CCC1CC(F)C(F)(C(O)C(=O)C(N)C(=O)NC2CCC(N(C)C)C2C2CC=CC=C2O)C1(O)F	TargetDiff	6FAF	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64013	[O]S1([O])C(O)CCN1C1C(=O)C(C(=O)NC(=O)c2cnccn2)C(O)C1F	TargetDiff	6FAF	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64014	C=C(CCC1C(F)C(C)C2C3=C(O)C(=O)C(O)=C3C(=O)NN12)CS(C)=O	TargetDiff	6FAF	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64015	CC1CC(C(=O)O)C2C(O)CS([O])([O])NC(C)(C)COC2C1C	TargetDiff	6FAF	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64016	CC=C[C@H]1CC2=C(CC[C@H](C)[C@@]1(C)c1ccc(CCC)cc1)CC(OCO)C2	TargetDiff	4P6W	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64017	CC1CC2=C(CNC2)C2=CC=CC(C(C)C3CCC(O)C4C(=O)C5CC(CC4C3)C(C)CC5O)C2C1	TargetDiff	4P6W	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64018	COC1OC(C(=O)C(O)C2CCc3c(S)cccc32)C(F)C1c1ccccc1	TargetDiff	4P6W	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64019	CC(=O)C1CCC(C)C(C2(O)CCC3(C4C=CC(C)C=C4)CC(C)CC(C)(C2)C3)CO1	TargetDiff	4P6W	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64020	CN1C(=O)CCC1c1ccc(CO)c(C2=NC(=O)C3CCCC34C3C=CCCN3CN24)c1	TargetDiff	4P6W	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

64006 to 64020 of 73725 items. Total 4915 pages.