Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
64051	Cc1cccc2c1C(=O)CN2C(C)C(C(N)=O)c1ccccc1	TargetDiff	6POI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64052	c1ccc(NCC2CCCN2)cc1	TargetDiff	6POI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64053	COC1CC2CC(F)C(C1)C(C)CC(C(=O)NC1C=CCC=C1)OC(=O)C1CC=CC3C1N(C)CCN3C2	TargetDiff	5NK6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64054	CCN1CCC2=C1C=NC1N=CC3=C4C=CCC=C4CN3C1=C2.Oc1cccc(F)c1O	TargetDiff	5NK6	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64055	CC1/C2=C/C3C=C(NC(=O)C3)C(C(=O)C=C=O)C(C)C3CNC(=N3)CC(C2)C1C(N)=O	TargetDiff	5NK6	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64056	C[C@H]1CC[C@H](C)C1(C)[C@@H](C)N=C[C@@H]1C=NC=C(C(=O)O)C1=C1C=CCC=C1	TargetDiff	5NK6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64057	CC1=Cc2c(c3c4c5c2=CCC=C5C2CC(O)(O)C2N(C(C)C)CC4C(C(C)C)=CN=3)C=CC1	TargetDiff	5NK6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64058	COC1C(=O)C2=C(Nc3cccc(Cl)c3CNC2=O)C(Cc2ccccc2CO)=C1O	TargetDiff	5NK6	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64059	O=C1NC(C2CCCC2)C/C=C2/C=NC3=C(CC(/C=C\c4cc(ccn4)CN4CC5=C(CC1N5)N4)C3)N=N2	TargetDiff	5NK6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64060	NC(=O)NC=N[C@@]12NNN=C1N(c1ccc(Cl)cc1)c1ccccc12	TargetDiff	5NK6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64061	C[C@]1(O)CC[C@H](CO)C(=O)O1.N=C1N=C/C2=N/C(=C[C@H]3C=C(F)[C@H]4CNCC4=C3)NCNCC2=N1	TargetDiff	5NK6	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64062	CCC(CC)C(C(O)C(O)C1C=CCC=C1)C(O)C(O)(O)C(OC(=O)OP(=O)(O)O)C(O)CC1CNCNC1	TargetDiff	5JSS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64063	N=C1CCC(OC2COC(OCC3(C(=O)NCCCS(O)(O)O)CCC(CO)C3O)C2O)N1	TargetDiff	5JSS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64064	CCCN(CC(O)(O)CC1CCOC1C(C)N1CCC2=C1CCC2)C1OC2(CCCC2F)OC1(O)F	TargetDiff	5JSS	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64065	CC1CC(C)C(O)C(NCO)C1.CCC(C)C(N)C(CO)Cc1ccc(OC)cc1	TargetDiff	5JSS	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

64051 to 64065 of 73725 items. Total 4915 pages.