Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
64156	CC(C)CC(O)CC(C)C	TargetDiff	3LI4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64157	CC(O)C(O)CC(=O)OC(CO)C(C(O)CO)C(O)C(O)CO	TargetDiff	3LI4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64158	CC1CC(N)C(C)C2(O)CN3C(CCC(CO)C3C)CC(O)C(O)CC2C1O	TargetDiff	3LI4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64159	CC1(CO)C(O)C(O)C2CCC(O)C(CCOC(=O)C3CCC(O)C(C3O)C1O)O2	TargetDiff	3LI4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64160	CC1C2(O)COC1(O)C(O)c1ccc(cc1)OCC(O)CC1OC3(CC2C(O)C3O)C(O)C1CO	TargetDiff	3LI4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64161	CC1OCC(CC(O)COCC(O)CC(=O)O)C(=O)O1	TargetDiff	3LI4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64162	O=C(O)N(CCO)CCCOC(COO)n1ccc(O)cc1=O	TargetDiff	3LI4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64163	CC1COC2SC3=C(C(O)C(C4OC(C(=O)O)CC4(C)c4ccccc4)C=C3)N12	TargetDiff	3LI4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64164	CC(C)C(=S)NCOP(=O)(O)C(O)C1=CCC=CC1	TargetDiff	3LI4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64165	OC1c2ccccc2CC1C(O)C(O)C(O)C1C=CC=CC=C1	TargetDiff	3LI4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64166	CC(O)C(C)C(O)C(O)C(O)C(O)OC1CCOC2C(O)COC12O	TargetDiff	3LI4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64167	CC1CCCCC(C2CC(O)(C(C)CO)CC2O)C1	TargetDiff	3LI4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64168	CC(C(O)CO)C(CC(O)(CCCC(C)C(C)(C)O)C(C)(O)CO)C(=O)O	TargetDiff	3LI4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64169	OCC(O)OC1C(O)C2CC(CF)C(O)OC21O	TargetDiff	3LI4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64170	CCC(C)C1CC=C2C(C(O)C(C)C(C)=O)CC3(O)CC4(O)C(C)C1(O)CC24C3O	TargetDiff	3LI4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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