Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
64291	CCN(C(=O)N1C=CN2C(=O)CN=C3SCC1=C32)S(O)(O)C1=CC=CC(C(O)(O)NC)C=C1	TargetDiff	4PXZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64292	NCC1(C(O)C(O)C(=O)OC(=O)C2CCC(OC(=O)O)C2O)CC2C=C(F)CC3=C2C(C(=O)N3)C(O)C1	TargetDiff	4PXZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64293	CC(CO)OC(C)CCCC(O)(O)CCNC(=O)CC(C)C(=O)O	TargetDiff	4PXZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64294	CCCCC(CCNC)C(O)(O)C1C(C(=O)OCOC(=O)CO)CC(O)C1(O)O	TargetDiff	4PXZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64295	Cc1ccc(C(O)C2NC3(O)CNC(C(O)(O)C(O)C(=O)O)CC3O2)c(O)c1	TargetDiff	4PXZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64296	CC1=CCCCC2=C1C=C(O)C(CC(OO)C(=O)C1CN(C(=O)NOP(=O)(O)O)CN1)O2	TargetDiff	4PXZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64297	CC(C=N)c1ccc(F)cc1C(=O)NCC(O)C(O)CCC(F)C1CC(C(=O)O)=C(C(O)(O)O)C1=N	TargetDiff	4PXZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64298	CC1=CC(N(C)O)C=C(CC(O)(O)C(O)CCC2CC(P(=O)(O)O)CS2)C1C	TargetDiff	4PXZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64299	O=C1CC2=C(CN1)CC(OC(O)C(CCC1(O)C(=O)C3=C(CCC3=O)C1CC(F)(F)F)C(=O)O)C(O)(O)C2	TargetDiff	4PXZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64300	CC1CCCC(=O)C2C(O)C3OC(CC(O)C(O)CNC(=O)O)C(O)C(O)(F)CC3C2C1O	TargetDiff	4PXZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64301	CC1CN(O)C(=O)C(O)(NC2OCC(C(O)C(=O)OP(=O)(O)O)OCC2O)C1C	TargetDiff	4PXZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64302	O=C(O)C1CC(CCOP(=O)(O)O)C=C1N(CO)c1cc2c(cn1)CCC2	TargetDiff	4PXZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64303	CC1C=CCC(C(O)CC(O)C(=O)OC2(COC(=O)O)CC(C)C(C(=O)O)C2O)C1O	TargetDiff	4PXZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64304	O=C(O)C(O)C(O)C(O)C1CCC(O)(C(O)CC2(O)c3cc(F)ccc3N(O)CC2O)C1	TargetDiff	4PXZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64305	CC(=O)C1C=C(C)CC(CC(O)(O)C2OCC(O)C(C(=O)O)C2OCO)NC1=O	TargetDiff	4PXZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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