Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
66451	CC(C)C(O)C(CC(=O)O)C1CCC(O)C2C(=O)N=C(CC3=CCC4=NC=NC(C(=O)ON)C4C=C3)ON12	TargetDiff	5ZDB	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66452	CNCC(O)CC1=NC(=N)N=C(C(=O)CC(O)CC(c2cccc(F)c2)N(C)c2ccc(C)cc2O)C1=S	TargetDiff	5ZDB	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66453	Oc1ccccc1C=C=C1CC2=C(C1)C1CC3OCOC3CN=C1N=C2	TargetDiff	5ZDB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66454	CC(=O)CC(C)C(O)C(CC1=NC(C)CCNC1)OC(O)C(=O)C1(O)OC(S)C#CC(O)C(O)(C(O)CO)COC2SOC21	TargetDiff	5ZDB	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66455	O=C(O)C1CCC(C(CC2CNC(c3ccccc3)C2)C(=O)O)C1	TargetDiff	5ZDB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66456	NC(=O)c1nccc(NCCC(O)(O)C(OCC(=O)O)OC(O)CO)n1	TargetDiff	5ZDB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66457	CN1CCC(N2CC(C3CCC(CC(N)=O)C3)NC2=O)C1=O	TargetDiff	5ZDB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66458	CCCC(O)CCCC1CC2C(OCC2C2C=CCCC2)O1	TargetDiff	5ZDB	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66459	CC(OC=C=C(C1CCSC1)N(C)c1nc2c3c(nnc4c3c1OCC4)CC=C2)C(=O)O	TargetDiff	5DH4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66460	CC1Oc2ccc3c(c2)C(=C=CC2(CC(=O)O)COCC12)NC(=N)N=C3	TargetDiff	5DH4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66461	COc1ccc(NC(C(CO)CO)C(NC(=O)c2c(C)ccc(F)c2O)c2ccccc2)c(F)c1	TargetDiff	5DH4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66462	COc1cc2c(n(N3CCCC(=O)C3CF)c1=O)CCC2	TargetDiff	5DH4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66463	CCCC(=N)C(C1=CCCC=C1)C1CC2=C(C1)N1C(C(CO)C(C)C)OCN1C2C(=O)O	TargetDiff	5DH4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66464	CC1N=CC(NC(=O)C(c2ccccc2)C(O)C(=O)O)c2cccc(O)c21	TargetDiff	5DH4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66465	CC(O)C1=CC(CN)C(C2CCC2)C=C1Cl	TargetDiff	5DH4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

66451 to 66465 of 73725 items. Total 4915 pages.