Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
67186	N=CN1CNCN=C2NCCC21	TargetDiff	4LM2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67187	CN1CN2CC3/C=C/C(=N\C4CCC5CC=CC6C(=O)N(C3=O)C4C56)CNc3ccc1c2c3	TargetDiff	4LM2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67188	CC1(O)CC2C(=O)N=CC=C2NCCN1	TargetDiff	4LM2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67189	O=C1CCC/C(O)=C/CCC2CN3/C(=N/1)N=CC=NC3c1cccnc12	TargetDiff	4LM2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67190	CC1N=C2CC=C3CN4C5CCN(C5)CC4N=c4cc5c(c2c43)=C1CC(F)=C5	TargetDiff	4YC0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67191	CC(OCN)C1C=C2C(C)N(C)CN2C2=C3C(=C4NCNN4C31)C=NC2	TargetDiff	4YC0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67192	CC1(O)C(O)COC1C1=C2C(=NCC(=O)N2O)C(=O)N1	TargetDiff	4YC0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67193	N=C1NC=C2C(=O)CN=CC2N1CC1CC2CC(C3C(=O)CC4C(O)OCCC43)CC2CN1	TargetDiff	4YC0	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67194	CC(O)C(C)CC1CN2C3CNC(F)(F)C4C5=CNN=CN5c5cccc(c5N34)C2(O)C1	TargetDiff	4YC0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67195	C1=Nc2nccc3c2C(NNCC3)C2CNCN12	TargetDiff	4YC0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67196	N=C1NC(=O)C2C3=CC(O)(O)CC4=C3C3C(=NC(O)C4)C=CC1=C23	TargetDiff	4YC0	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67197	O=C1C=NC2=CNN3CC4=C5C3=C2C1=C(O)C(C(=O)O)C5CC4	TargetDiff	4YC0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67198	NC(=O)C1=C2C/N=C3/C=NC=CN3C(=O)N(CCO)CC2C(F)=C1Cl	TargetDiff	4YC0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67199	C[PH]1(PPOO)CSP(NO)[SH](O)CS[SH](NOO)CC1C=O	TargetDiff	2AZY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67200	CCC1N=CN=C(C)C1C(=O)N(NC1=CC=CC(N)=CC1OC)c1cccnc1	TargetDiff	2AZY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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